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李东风在北京大学数学科学学院开设本科生《统计软件》教材。

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1 R 语 言 介 绍 | R 语 言 教 程 R 语 言 教 程 前 言 I 介 绍 1 R 语 言 介 绍 1 . 1 R 的 历 史 和 特 点 1 . 1 . 1 R 的 历 史 1 . 1 . 2 R 的 特 点 1 . 2 参 考 资 料 1 . 2 . 1 推 荐 参 考 书 1 . 2 . 2 其 它 参 考 书 1 . 3 R 的 下 载 与 安 装 1 . 3 . 1 R 的 下 载 1 . 3 . 2 R 软 件 安 装 1 . 3 . 3 辅 助 软 件 1 . 4 R 扩 展 软 件 包 的 安 装 与 管 理 1 . 4 . 1 扩 展 包 使 用 1 . 4 . 2 安 装 1 . 4 . 3 G i t h u b 和 B i o C o n d u c t o r 的 扩 展 包 1 . 4 . 4 更 新 扩 展 包 1 . 4 . 5 迁 移 扩 展 包 1 . 4 . 6 项 目 私 有 扩 展 包 目 录 1 . 5 基 本 R 软 件 的 用 法 1 . 5 . 1 基 本 运 行 1 . 5 . 2 项 目 目 录 1 . 6 R S t u d i o 软 件 1 . 6 . 1 介 绍 1 . 6 . 2 项 目 1 . 6 . 3 帮 助 1 . 6 . 4 使 用 技 巧 1 . 7 Q m d 文 件 1 . 8 练 习 2 R 语 言 入 门 运 行 样 例 2 . 1 命 令 行 界 面 2 . 2 四 则 运 算 2 . 2 . 1 练 习 2 . 3 数 学 函 数 2 . 3 . 1 数 学 函 数 — — 平 方 根 、 指 数 、 对 数 2 . 3 . 2 数 学 函 数 — — 取 整 2 . 3 . 3 数 学 函 数 — — 三 角 函 数 2 . 3 . 4 数 学 函 数 — — 反 三 角 函 数 2 . 3 . 5 分 布 函 数 和 分 位 数 函 数 2 . 4 函 数 调 用 和 自 定 义 函 数 2 . 5 输 出 2 . 5 . 1 简 单 输 出 2 . 5 . 2 用 s i n k ( ) 函 数 作 运 行 记 录 2 . 5 . 3 练 习 2 . 6 向 量 计 算 与 变 量 赋 值 2 . 7 工 作 空 间 介 绍 2 . 7 . 1 练 习 2 . 8 绘 图 示 例 2 . 8 . 1 函 数 曲 线 示 例 2 . 8 . 2 条 形 图 示 例 2 . 8 . 3 散 点 图 示 例 2 . 8 . 4 R 软 件 自 带 的 图 形 示 例 2 . 8 . 5 练 习 2 . 9 汇 总 统 计 示 例 2 . 9 . 1 表 格 数 据 2 . 9 . 2 读 入 表 格 数 据 2 . 9 . 3 练 习 2 . 9 . 4 分 类 变 量 频 数 统 计 2 . 9 . 5 数 值 型 变 量 的 统 计 2 . 9 . 6 练 习 2 . 1 0 运 行 源 程 序 文 件 2 . 1 0 . 1 源 文 件 编 码 2 . 1 0 . 2 当 前 工 作 目 录 2 . 1 0 . 3 练 习 2 . 1 1 附 录 ： 数 据 2 . 1 1 . 1 公 司 纳 税 数 据 样 例 I I 数 据 类 型 与 相 应 的 运 算 3 常 量 与 变 量 3 . 1 常 量 3 . 2 变 量 3 . 3 R 数 据 类 型 4 数 值 型 向 量 及 其 运 算 4 . 1 数 值 型 向 量 4 . 2 向 量 运 算 4 . 2 . 1 标 量 和 标 量 运 算 4 . 2 . 2 向 量 与 标 量 运 算 4 . 2 . 3 等 长 向 量 运 算 4 . 2 . 4 不 等 长 向 量 的 运 算 4 . 3 向 量 函 数 4 . 3 . 1 向 量 化 的 函 数 4 . 3 . 2 排 序 函 数 4 . 3 . 3 统 计 函 数 4 . 3 . 4 生 成 规 则 序 列 的 函 数 4 . 4 复 数 向 量 4 . 5 练 习 5 逻 辑 型 向 量 及 其 运 算 5 . 1 逻 辑 型 向 量 与 比 较 运 算 5 . 2 逻 辑 运 算 5 . 3 逻 辑 运 算 函 数 6 字 符 型 数 据 及 其 处 理 6 . 1 字 符 型 向 量 6 . 2 转 义 字 符 和 原 始 字 符 串 6 . 3 p a s t e 函 数 6 . 4 转 换 大 小 写 6 . 5 字 符 串 长 度 6 . 6 取 子 串 6 . 7 类 型 转 换 6 . 8 字 符 串 替 换 功 能 6 . 9 正 则 表 达 式 7 R 向 量 下 标 和 子 集 7 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t _ r e o r d e r 1 0 . 5 . 3 f c t _ i n f r e q 1 0 . 5 . 4 f c t _ r e c o d e 1 0 . 6 练 习 1 1 列 表 类 型 1 1 . 1 列 表 1 1 . 2 列 表 元 素 访 问 1 1 . 3 列 表 类 型 转 换 1 1 . 4 连 接 列 表 1 1 . 5 返 回 列 表 的 函 数 示 例 – s t r s p l i t ( ) 1 2 R 矩 阵 和 数 组 1 2 . 1 R 矩 阵 1 2 . 2 矩 阵 子 集 1 2 . 3 c b i n d ( ) 和 r b i n d ( ) 函 数 1 2 . 4 矩 阵 运 算 1 2 . 4 . 1 四 则 运 算 1 2 . 4 . 2 矩 阵 乘 法 1 2 . 4 . 3 向 量 与 矩 阵 相 乘 1 2 . 4 . 4 内 积 1 2 . 4 . 5 外 积 1 2 . 5 逆 矩 阵 与 线 性 方 程 组 求 解 1 2 . 6 a p p l y ( ) 函 数 1 2 . 7 多 维 数 组 1 2 . 8 列 表 类 型 的 数 组 1 3 数 据 框 1 3 . 1 数 据 框 1 3 . 1 . 1 数 据 框 定 义 1 3 . 1 . 2 数 据 框 显 示 1 3 . 1 . 3 数 据 框 内 容 访 问 1 3 . 1 . 4 数 据 框 的 行 名 1 3 . 1 . 5 数 据 框 与 矩 阵 的 区 别 1 3 . 2 t i b b l e 类 型 1 3 . 2 . 1 生 成 方 法 1 3 . 2 . 2 列 子 集 问 题 1 3 . 2 . 3 行 名 问 题 1 3 . 2 . 4 b i b b l e 和 数 据 框 的 转 换 1 3 . 2 . 5 列 表 类 型 的 列 1 3 . 3 练 习 1 4 工 作 空 间 和 变 量 赋 值 1 4 . 1 工 作 空 间 1 4 . 2 非 法 变 量 名 1 4 . 3 变 量 赋 值 与 绑 定 1 4 . 4 环 境 I I I 编 程 1 5 R 输 入 输 出 1 5 . 1 输 入 输 出 的 简 单 方 法 1 5 . 1 . 1 简 单 的 输 出 1 5 . 1 . 2 简 单 的 输 入 1 5 . 2 读 取 C S V 文 件 1 5 . 2 . 1 C S V 格 式 1 5 . 2 . 2 从 字 符 串 读 入 1 5 . 2 . 3 r e a d _ c s v 选 项 1 5 . 2 . 4 编 码 设 置 1 5 . 2 . 5 缺 失 值 设 置 1 5 . 2 . 6 各 列 类 型 设 置 1 5 . 2 . 7 因 子 类 型 设 置 1 5 . 2 . 8 读 入 日 期 1 5 . 2 . 9 其 它 函 数 1 5 . 3 保 存 与 恢 复 R 变 量 1 5 . 4 E x c e l 表 访 问 1 5 . 4 . 1 借 助 于 文 本 格 式 1 5 . 4 . 2 使 用 剪 贴 板 1 5 . 4 . 3 利 用 r e a d x l 扩 展 包 1 5 . 5 用 d a t a . t a b l e 包 读 入 数 据 1 5 . 6 文 件 访 问 1 5 . 6 . 1 连 接 1 5 . 6 . 2 文 本 文 件 访 问 1 5 . 6 . 3 文 本 文 件 分 批 读 写 1 5 . 6 . 4 二 进 制 文 件 访 问 1 5 . 6 . 5 字 符 型 连 接 1 5 . 7 中 文 编 码 问 题 1 5 . 7 . 1 用 基 本 R 的 读 取 函 数 读 取 1 5 . 7 . 2 用 r e a d r 包 读 取 1 5 . 7 . 3 输 出 文 件 的 编 码 1 5 . 7 . 4 编 码 转 换 1 5 . 8 目 录 和 文 件 管 理 1 6 程 序 控 制 结 构 1 6 . 1 表 达 式 1 6 . 2 分 支 结 构 1 6 . 2 . 1 用 逻 辑 下 标 代 替 分 支 结 构 1 6 . 2 . 2 i f e l s e 函 数 1 6 . 2 . 3 s w i t c h 函 数 1 6 . 3 循 环 结 构 1 6 . 3 . 1 计 数 循 环 1 6 . 3 . 2 w h i l e 循 环 和 r e p e a t 循 环 1 6 . 4 R 中 判 断 条 件 1 6 . 5 管 道 控 制 1 7 函 数 1 7 . 1 函 数 基 础 1 7 . 1 . 1 介 绍 1 7 . 1 . 2 函 数 定 义 1 7 . 1 . 3 函 数 调 用 1 7 . 1 . 4 函 数 复 合 调 用 与 管 道 运 算 符 1 7 . 1 . 5 递 归 调 用 1 7 . 1 . 6 向 量 化 1 7 . 1 . 7 无 名 函 数 1 7 . 2 变 量 作 用 域 1 7 . 2 . 1 全 局 变 量 和 工 作 空 间 1 7 . 2 . 2 局 部 变 量 1 7 . 2 . 3 在 函 数 内 访 问 全 局 变 量 1 8 R 程 序 效 率 1 8 . 1 R 的 运 行 效 率 1 8 . 2 性 能 比 较 和 向 量 化 编 程 示 例 1 8 . 3 减 少 显 式 循 环 1 8 . 3 . 1 r e p l i c a t e ( ) 函 数 1 8 . 4 避 免 制 作 副 本 1 8 . 5 用 性 能 分 析 工 具 找 到 程 序 效 率 的 瓶 颈 1 8 . 6 R 的 计 算 函 数 1 8 . 6 . 1 数 学 函 数 1 8 . 6 . 2 概 括 函 数 1 8 . 6 . 3 最 值 1 8 . 6 . 4 排 序 1 8 . 6 . 5 一 元 定 积 分 i n t e g r a t e 1 8 . 6 . 6 一 元 函 数 求 根 u n i r o o t 1 8 . 6 . 7 离 散 傅 立 叶 变 换 f f t 1 8 . 6 . 8 用 f i l t e r 函 数 作 迭 代 1 8 . 7 并 行 计 算 1 8 . 7 . 1 例 1 ： 完 全 不 互 相 依 赖 的 并 行 运 算 1 8 . 7 . 2 例 2 ： 使 用 相 同 随 机 数 序 列 的 并 行 计 算 1 8 . 7 . 3 例 3 ： 使 用 独 立 随 机 数 序 列 的 并 行 计 算 1 8 . 7 . 4 其 它 并 行 计 算 扩 展 包 1 8 . 7 . 5 用 f o r e a c h 重 算 例 1 1 9 函 数 进 阶 1 9 . 1 函 数 调 用 的 各 种 形 式 1 9 . 2 嵌 套 定 义 与 句 法 作 用 域 ( l e x i c a l s c o p i n g ) 1 9 . 3 辅 助 嵌 套 函 数 1 9 . 4 懒 惰 求 值 1 9 . 5 程 序 调 试 1 9 . 5 . 1 基 本 调 试 策 略 1 9 . 5 . 2 找 到 出 错 的 函 数 1 9 . 5 . 3 跟 踪 调 试 1 9 . 5 . 4 条 件 断 点 1 9 . 5 . 5 开 启 对 一 个 函 数 的 调 试 1 9 . 5 . 6 出 错 调 试 选 项 1 9 . 5 . 7 s t o p ( ) 、 w a r n i n g ( ) 、 m e s s a g e ( ) 1 9 . 5 . 8 预 防 性 设 计 1 9 . 5 . 9 出 错 处 理 机 制 1 9 . 6 单 元 测 试 1 9 . 7 环 境 1 9 . 7 . 1 基 本 概 念 1 9 . 7 . 2 逐 层 向 上 访 问 环 境 1 9 . 7 . 3 特 殊 环 境 1 9 . 7 . 4 调 用 栈 1 9 . 7 . 5 将 环 境 用 作 一 般 数 据 结 构 I V 研 究 项 目 管 理 和 研 究 报 告 2 0 研 究 项 目 管 理 2 0 . 1 可 重 复 式 科 学 研 究 2 0 . 2 备 份 2 0 . 3 源 代 码 管 理 2 0 . 4 单 元 测 试 2 0 . 5 阶 段 任 务 管 理 2 0 . 6 文 学 式 编 程 2 1 M a r k d o w n 格 式 2 1 . 1 介 绍 2 1 . 2 M a r k d o w n 格 式 文 件 的 应 用 2 1 . 3 m a r k d o w n 格 式 说 明 2 1 . 3 . 1 概 述 2 1 . 3 . 2 段 落 2 1 . 3 . 3 段 内 文 字 格 式 2 1 . 3 . 4 标 题 和 分 隔 线 2 1 . 3 . 5 引 用 段 落 2 1 . 3 . 6 列 表 2 1 . 3 . 7 源 程 序 2 1 . 3 . 8 链 接 2 1 . 3 . 9 插 入 图 形 2 1 . 3 . 1 0 表 格 2 1 . 4 附 录 ： p a n d o c 软 件 介 绍 2 2 Q u a r t o 格 式 文 件 2 2 . 1 介 绍 2 2 . 2 安 装 2 2 . 3 简 单 样 例 文 件 2 2 . 4 R S t u d i o 的 可 视 化 编 辑 2 2 . 5 生 成 输 出 文 件 2 2 . 5 . 1 使 用 R S t u d i o 2 2 . 5 . 2 使 用 Q u a r t o 可 执 行 程 序 2 2 . 5 . 3 J u p y t e r 笔 记 本 源 文 件 的 转 换 2 2 . 6 插 入 R 程 序 代 码 2 2 . 7 代 码 段 选 项 2 2 . 7 . 1 标 签 2 2 . 7 . 2 代 码 段 执 行 选 项 2 2 . 8 插 图 2 2 . 8 . 1 插 图 方 法 2 2 . 8 . 2 插 图 有 关 代 码 段 选 项 2 2 . 9 插 入 表 格 2 2 . 1 0 数 学 公 式 2 2 . 1 0 . 1 在 M a r k d o w n 中 输 入 数 学 公 式 2 2 . 1 0 . 2 数 学 公 式 类 别 2 2 . 1 0 . 3 基 本 功 能 2 2 . 1 0 . 4 修 饰 符 2 2 . 1 0 . 5 对 齐 与 矩 阵 2 2 . 1 0 . 6 特 殊 字 体 2 2 . 1 0 . 7 数 学 公 式 引 用 2 2 . 1 0 . 8 数 学 公 式 的 显 示 设 置 2 2 . 1 1 设 置 2 2 . 1 1 . 1 使 用 单 个 源 文 件 2 2 . 1 1 . 2 生 成 图 书 2 2 . 1 1 . 3 图 书 章 节 结 构 2 2 . 1 1 . 4 多 种 输 出 格 式 2 2 . 1 1 . 5 目 录 2 2 . 1 1 . 6 中 文 支 持 2 2 . 1 1 . 7 参 考 文 献 数 据 库 设 置 2 2 . 1 1 . 8 其 它 选 项 2 2 . 1 2 定 理 类 2 2 . 1 3 引 用 2 2 . 1 3 . 1 引 用 章 节 2 2 . 1 3 . 2 可 引 用 插 图 和 表 格 2 2 . 1 3 . 3 图 、 表 、 交 叉 引 用 定 制 2 2 . 1 4 代 码 段 缓 存 2 2 . 1 5 编 译 管 理 2 2 . 1 5 . 1 增 量 转 换 2 2 . 1 5 . 2 冻 结 版 本 2 2 . 1 6 制 作 演 示 文 稿 2 2 . 1 7 运 行 J u l i a 程 序 2 2 . 1 8 用 作 科 学 计 算 笔 记 本 2 2 . 1 9 问 题 2 2 . 2 0 附 录 ： T i n y T e x 的 安 装 使 用 2 2 . 2 0 . 1 基 于 Q u a r t o 可 执 行 程 序 2 2 . 2 0 . 2 基 于 R S t u d i o V 数 据 整 理 与 汇 总 2 3 数 据 整 理 2 3 . 1 t i d y v e r s e 系 统 2 3 . 2 查 看 数 据 框 一 般 信 息 2 3 . 3 用 f i l t e r ( ) 选 择 行 子 集 2 3 . 4 按 行 序 号 选 择 行 子 集 2 3 . 5 用 s a m p l e _ n ( ) 对 观 测 随 机 抽 样 2 3 . 6 用 d i s t i n c t ( ) 去 除 重 复 行 2 3 . 7 用 d r o p _ n a ( ) 去 除 指 定 的 变 量 有 缺 失 值 的 行 2 3 . 8 用 s e l e c t ( ) 选 择 列 子 集 2 3 . 9 取 出 单 个 变 量 为 向 量 2 3 . 1 0 用 a r r a n g e ( ) 排 序 2 3 . 1 1 用 r e n a m e ( ) 修 改 变 量 名 2 3 . 1 2 用 r e l o c a t e ( ) 调 整 变 量 次 序 2 3 . 1 3 用 m u t a t e ( ) 计 算 新 变 量 2 3 . 1 4 用 t r a n m u t e ( ) 生 成 新 变 量 的 数 据 框 2 3 . 1 5 缺 失 值 填 补 2 3 . 1 6 用 管 道 连 接 多 次 操 作 2 3 . 1 7 e x p a n d _ g r i d ( ) 函 数 2 3 . 1 8 宽 表 转 换 为 长 表 2 3 . 1 8 . 1 p i v o t _ l o n g e r 函 数 2 3 . 1 8 . 2 从 列 名 中 提 取 数 值 2 3 . 1 8 . 3 从 列 名 中 提 取 多 个 分 类 变 量 值 2 3 . 1 8 . 4 一 行 中 有 多 个 属 性 的 多 次 观 测 的 情 形 2 3 . 1 9 长 表 转 换 为 宽 表 2 3 . 1 9 . 1 将 多 个 混 在 一 起 的 变 量 拆 开 2 3 . 1 9 . 2 将 多 个 类 别 合 并 到 一 个 观 测 2 3 . 1 9 . 3 将 交 叉 类 别 合 并 到 一 个 观 测 2 3 . 1 9 . 4 多 个 变 量 的 多 种 值 2 3 . 1 9 . 5 长 宽 转 换 混 合 使 用 2 3 . 2 0 拆 分 数 据 列 2 3 . 2 0 . 1 s e p a r a t e 函 数 2 3 . 2 0 . 2 e x t r a c t 函 数 2 3 . 2 0 . 3 s e p a r a t e _ w i d e r _ d e l i m 函 数 2 3 . 2 0 . 4 s e p a r a t e _ l o n g e r _ d e l i m 函 数 2 3 . 2 1 合 并 数 据 列 2 3 . 2 2 数 据 框 纵 向 合 并 2 3 . 2 3 横 向 合 并 2 3 . 2 3 . 1 连 接 介 绍 2 3 . 2 3 . 2 一 对 一 内 连 接 2 3 . 2 3 . 3 多 对 一 左 连 接 2 3 . 2 3 . 4 右 连 接 和 外 连 接 2 3 . 2 3 . 5 两 两 组 合 2 3 . 2 3 . 6 利 用 第 二 个 数 据 集 筛 选 2 3 . 2 3 . 7 非 相 等 条 件 的 连 接 2 3 . 2 4 数 据 集 的 集 合 操 作 2 3 . 2 5 标 准 化 2 3 . 2 6 读 入 多 个 文 件 2 3 . 2 7 使 用 d a t a . t a b l e 包 2 3 . 2 7 . 1 查 询 2 3 . 2 7 . 2 行 子 集 与 排 序 2 3 . 2 7 . 3 列 子 集 2 3 . 2 7 . 4 计 算 汇 总 2 3 . 2 7 . 5 用 b y 做 分 组 汇 总 2 3 . 2 7 . 6 分 组 汇 总 并 将 结 果 排 序 2 3 . 2 7 . 7 数 据 子 集 . S D 2 3 . 2 7 . 8 以 引 用 方 式 增 添 、 修 改 、 删 除 列 2 3 . 2 7 . 9 使 用 关 键 列 2 3 . 2 7 . 1 0 使 用 辅 助 索 引 列 2 3 . 2 7 . 1 1 横 向 合 并 2 3 . 2 7 . 1 2 长 宽 表 转 换 2 3 . 2 8 数 据 库 访 问 与 S Q L 2 4 数 据 汇 总 2 4 . 1 用 d p l y r 作 数 据 汇 总 2 4 . 2 多 个 变 量 的 汇 总 2 4 . 2 . 1 修 改 多 个 变 量 2 4 . 2 . 2 针 对 多 个 变 量 进 行 筛 选 2 4 . 3 用 d p l y r 作 数 据 分 组 汇 总 2 4 . 3 . 1 简 单 汇 总 2 4 . 3 . 2 满 足 条 件 汇 总 2 4 . 3 . 3 分 组 筛 选 2 4 . 3 . 4 分 组 计 算 新 变 量 2 4 . 3 . 5 按 前 后 变 化 分 组 2 4 . 4 交 叉 分 类 的 汇 总 2 4 . 4 . 1 简 单 例 子 2 4 . 4 . 2 分 组 信 息 残 留 问 题 2 4 . 5 在 自 定 义 函 数 中 使 用 d p l y r 功 能 2 4 . 6 数 据 分 析 流 程 控 制 2 4 . 7 基 本 R 的 汇 总 功 能 2 4 . 7 . 1 s u m m a r y ( ) 函 数 2 4 . 7 . 2 连 续 型 变 量 概 括 函 数 2 4 . 7 . 3 分 类 变 量 概 括 2 4 . 7 . 4 数 据 框 概 括 2 4 . 8 用 基 本 R 作 分 类 汇 总 2 4 . 8 . 1 用 t a p p l y ( ) 分 组 汇 总 2 4 . 8 . 2 用 a g g r e g a t e ( ) 分 组 概 括 数 据 框 2 4 . 8 . 3 用 s p l i t ( ) 函 数 分 组 后 概 括 2 4 . 9 用 p l y r 包 进 行 分 类 概 括 2 4 . 1 0 练 习 2 5 函 数 式 编 程 和 数 据 框 列 表 列 2 5 . 1 函 数 式 编 程 介 绍 2 5 . 1 . 1 纯 函 数 2 5 . 1 . 2 副 作 用 和 运 行 环 境 恢 复 2 5 . 1 . 3 R 的 函 数 式 编 程 功 能 2 5 . 2 泛 函 2 5 . 2 . 1 p u r r r : : m a p 函 数 2 5 . 2 . 2 p u r r r 包 中 m a p 函 数 的 变 种 2 5 . 2 . 3 p u r r r 包 中 r e d u c e 类 函 数 2 5 . 2 . 4 p u r r r 包 中 使 用 示 性 函 数 的 泛 函 2 5 . 2 . 5 基 本 R 的 函 数 式 编 程 支 持 2 5 . 2 . 6 自 定 义 泛 函 2 5 . 3 函 数 工 厂 2 5 . 3 . 1 闭 包 例 子 2 5 . 3 . 2 动 态 查 找 和 懒 惰 求 值 引 起 的 问 题 2 5 . 3 . 3 函 数 工 厂 的 内 存 负 担 2 5 . 3 . 4 函 数 算 子 2 5 . 4 t i b b l e 中 的 列 表 列 2 5 . 4 . 1 n e s t 和 u n n e s t 2 5 . 4 . 2 g r o u p _ b y 与 n e s t 配 合 2 5 . 4 . 3 s u m m a r i s e 统 计 量 用 列 表 表 示 2 5 . 4 . 4 u n n e s t 的 语 法 格 式 2 5 . 4 . 5 直 接 生 成 列 表 类 型 的 列 V I 绘 图 2 6 基 本 R 绘 图 2 6 . 1 常 用 高 级 图 形 2 6 . 1 . 1 条 形 图 2 6 . 1 . 2 直 方 图 和 密 度 估 计 图 2 6 . 1 . 3 盒 形 图 2 6 . 1 . 4 正 态 Q Q 图 2 6 . 1 . 5 散 点 图 2 6 . 1 . 6 曲 线 图 2 6 . 1 . 7 三 维 图 2 6 . 1 . 8 动 态 三 维 图 2 6 . 2 低 级 图 形 函 数 2 6 . 2 . 1 a b l i n e ( ) 2 6 . 2 . 2 p o i n t s ( ) 2 6 . 2 . 3 l i n e s ( ) 2 6 . 2 . 4 图 例 2 6 . 2 . 5 a x i s ( ) 2 6 . 2 . 6 t e x t ( ) 2 6 . 2 . 7 l o c a t o r ( ) 和 i d e n t i f y ( ) 2 6 . 3 图 形 参 数 2 6 . 3 . 1 例 子 ： 用 图 形 参 数 解 决 b a r p l o t 图 形 横 坐 标 值 过 宽 2 6 . 3 . 2 图 形 元 素 控 制 2 6 . 3 . 3 坐 标 轴 与 坐 标 刻 度 2 6 . 3 . 4 图 形 边 空 2 6 . 3 . 5 一 页 多 图 2 6 . 4 图 形 输 出 2 6 . 4 . 1 P D F 输 出 2 6 . 4 . 2 P N G 输 出 2 6 . 5 包 含 多 种 中 文 字 体 的 图 形 2 6 . 6 其 它 图 形 2 6 . 6 . 1 相 关 系 数 图 2 7 g g p l o t 作 图 入 门 2 7 . 1 介 绍 2 7 . 2 作 图 的 一 般 原 则 2 7 . 3 散 点 图 ： g g p l o t 入 门 2 7 . 3 . 1 基 本 的 散 点 图 2 7 . 3 . 2 逐 步 改 善 2 7 . 3 . 3 颜 色 、 符 号 、 线 型 等 映 射 2 7 . 3 . 4 在 g e o m 函 数 中 映 射 变 量 2 7 . 3 . 5 连 续 变 量 的 颜 色 映 射 2 7 . 3 . 6 保 存 图 像 2 7 . 4 折 线 图 、 分 组 、 切 片 2 7 . 4 . 1 图 形 中 的 分 组 和 折 线 图 2 7 . 4 . 2 切 片 ( f a c e t ) 2 7 . 5 数 据 变 换 与 条 形 图 2 7 . 5 . 1 分 段 与 并 列 条 形 图 2 7 . 5 . 2 条 形 图 的 其 它 应 用 2 7 . 6 直 方 图 与 密 度 估 计 2 7 . 7 绘 图 语 法 介 绍 2 7 . 7 . 1 绘 图 语 法 2 7 . 7 . 2 图 形 种 类 2 7 . 8 更 多 图 形 种 类 2 7 . 8 . 1 连 续 变 量 的 分 组 图 形 2 7 . 8 . 2 坐 标 系 中 的 文 字 2 7 . 8 . 3 文 字 选 项 2 7 . 8 . 4 标 出 特 殊 点 2 7 . 9 刻 度 ( s c a l e ) 2 7 . 1 0 如 何 使 用 颜 色 2 7 . 1 0 . 1 名 义 型 变 量 的 颜 色 2 7 . 1 0 . 2 色 块 图 2 7 . 1 0 . 3 有 序 型 变 量 的 颜 色 2 7 . 1 0 . 4 相 异 型 变 量 的 颜 色 2 7 . 1 0 . 5 连 续 数 值 变 量 的 颜 色 2 7 . 1 1 标 题 、 标 注 、 指 南 2 7 . 1 1 . 1 标 题 2 7 . 1 1 . 2 标 注 功 能 2 7 . 1 1 . 3 指 南 ( g u i d e s ) 2 7 . 1 2 拼 接 图 形 2 7 . 1 2 . 1 利 用 p a t c h w o r k 包 拼 接 图 形 2 7 . 1 2 . 2 利 用 c o w p l o t 包 拼 接 图 形 2 7 . 1 3 主 题 2 7 . 1 4 图 形 定 制 调 整 2 7 . 1 4 . 1 图 形 逐 步 调 整 例 子 2 7 . 1 5 在 自 定 义 函 数 中 调 用 图 形 函 数 2 7 . 1 6 交 互 作 图 、 动 态 图 形 2 7 . 1 7 参 考 文 献 2 8 g g p l o t 的 各 种 图 形 2 8 . 1 介 绍 2 8 . 2 表 现 数 量 2 8 . 2 . 1 条 形 图 2 8 . 2 . 2 点 图 2 8 . 2 . 3 热 力 图 2 8 . 3 表 现 分 布 2 8 . 3 . 1 单 个 一 元 分 布 的 直 方 图 与 密 度 估 计 图 2 8 . 3 . 2 多 个 一 元 分 布 的 直 方 图 和 密 度 图 形 2 8 . 3 . 3 经 验 分 布 函 数 图 2 8 . 3 . 4 Q Q 图 2 8 . 3 . 5 盒 形 图 2 8 . 3 . 6 小 提 琴 图 2 8 . 3 . 7 蜂 群 图 2 8 . 3 . 8 多 个 密 度 的 其 它 画 法 2 8 . 3 . 9 二 元 分 布 直 方 图 和 等 值 线 图 2 8 . 4 表 现 比 例 2 8 . 4 . 1 单 个 分 布 2 8 . 4 . 2 组 间 的 比 例 分 布 的 比 较 2 8 . 4 . 3 嵌 套 比 例 分 布 的 比 较 2 8 . 5 表 现 多 个 变 量 间 的 关 系 2 8 . 5 . 1 散 点 图 2 8 . 5 . 2 散 点 图 矩 阵 2 8 . 5 . 3 相 关 系 数 矩 阵 图 2 8 . 5 . 4 等 值 线 图 和 热 力 图 2 8 . 5 . 5 数 据 降 维 2 8 . 5 . 6 成 对 数 据 2 8 . 5 . 7 平 行 坐 标 图 2 8 . 5 . 8 雷 达 图 2 8 . 6 时 间 序 列 图 2 8 . 6 . 1 一 元 时 间 序 列 2 8 . 6 . 2 多 元 时 间 序 列 2 8 . 6 . 3 多 个 不 同 类 型 指 标 的 时 间 序 列 2 8 . 7 拟 合 曲 线 图 2 8 . 7 . 1 平 滑 方 法 2 8 . 7 . 2 参 数 模 型 方 法 2 8 . 8 表 现 不 确 定 性 2 8 . 8 . 1 表 现 概 率 2 8 . 8 . 2 表 现 点 估 计 精 度 2 8 . 8 . 3 拟 合 曲 线 的 置 信 带 2 8 . 8 . 4 随 机 结 果 动 态 演 示 V I I 统 计 模 型 2 9 探 索 性 数 据 分 析 2 9 . 1 单 个 分 类 变 量 分 布 2 9 . 2 单 个 区 间 型 变 量 分 布 2 9 . 3 用 s k i m r 进 行 简 单 概 括 2 9 . 4 两 个 分 类 变 量 之 间 的 关 系 2 9 . 5 一 个 分 类 变 量 与 一 个 区 间 型 变 量 之 间 的 关 系 2 9 . 6 两 个 区 间 型 变 量 之 间 的 关 系 2 9 . 7 一 个 分 类 变 量 对 两 个 区 间 型 变 量 的 影 响 2 9 . 8 时 间 序 列 数 据 3 0 R 初 等 统 计 分 析 3 0 . 1 概 率 分 布 3 0 . 2 最 大 似 然 估 计 3 0 . 2 . 1 一 元 正 态 分 布 参 数 最 大 似 然 估 计 3 0 . 3 单 样 本 均 值 的 检 验 和 置 信 区 间 3 0 . 3 . 1 大 样 本 情 形 3 0 . 3 . 2 小 样 本 正 态 情 形 3 0 . 3 . 3 统 计 假 设 检 验 显 著 性 的 解 释 3 0 . 3 . 4 置 信 区 间 与 双 侧 检 验 的 关 系 3 0 . 3 . 5 单 样 本 均 值 比 较 例 子 3 0 . 3 . 6 单 样 本 均 值 比 较 样 本 量 和 功 效 计 算 3 0 . 4 均 值 比 较 3 0 . 4 . 1 独 立 两 样 本 Z 检 验 3 0 . 4 . 2 独 立 两 样 本 t 检 验 3 0 . 4 . 3 成 对 均 值 比 较 问 题 3 0 . 4 . 4 均 值 比 较 的 例 子 3 0 . 4 . 5 均 值 比 较 的 样 本 量 和 功 效 计 算 3 0 . 4 . 6 多 元 均 值 置 信 域 3 0 . 5 单 个 比 例 的 假 设 检 验 和 置 信 区 间 3 0 . 5 . 1 方 法 3 0 . 5 . 2 高 尔 夫 培 训 女 生 比 例 检 验 例 子 3 0 . 5 . 3 单 个 比 例 检 验 的 样 本 量 和 功 效 3 0 . 6 两 个 比 例 的 比 较 3 0 . 6 . 1 方 法 3 0 . 6 . 2 报 税 代 理 分 理 处 的 错 误 率 比 较 3 0 . 6 . 3 比 例 比 较 的 样 本 量 3 0 . 7 方 差 的 假 设 检 验 和 置 信 区 间 3 0 . 7 . 1 单 总 体 方 差 的 假 设 检 验 和 置 信 区 间 3 0 . 7 . 2 独 立 两 总 体 方 差 的 比 较 3 0 . 7 . 3 方 差 检 验 例 子 3 0 . 8 拟 合 优 度 检 验 3 0 . 8 . 1 各 类 比 例 相 等 的 检 验 3 0 . 8 . 2 各 类 比 例 为 指 定 值 的 检 验 3 0 . 8 . 3 带 有 未 知 参 数 的 单 分 类 变 量 的 拟 合 优 度 假 设 检 验 3 0 . 8 . 4 拟 合 优 度 检 验 的 功 效 和 样 本 量 3 0 . 9 检 验 分 布 类 型 3 0 . 1 0 列 联 表 独 立 性 卡 方 检 验 3 0 . 1 0 . 1 检 验 方 法 3 0 . 1 0 . 2 列 联 表 独 立 性 卡 方 检 验 例 子 3 0 . 1 0 . 3 功 效 与 样 本 量 计 算 3 0 . 1 1 非 参 数 检 验 3 0 . 1 1 . 1 单 样 本 的 符 号 秩 检 验 3 0 . 1 1 . 2 独 立 两 样 本 比 较 的 W i l c o x o n 秩 和 检 验 3 0 . 1 1 . 3 成 对 比 较 的 W i l c o x o n 配 对 检 验 3 1 使 用 i n f e r 包 进 行 统 计 推 断 3 1 . 1 单 样 本 均 值 的 比 较 3 1 . 1 . 1 随 机 模 拟 方 法 3 1 . 1 . 2 理 论 方 法 3 1 . 2 独 立 两 样 本 均 值 比 较 3 1 . 3 成 对 均 值 比 较 3 1 . 4 单 样 本 比 例 的 比 较 3 1 . 5 独 立 两 样 本 比 例 的 比 较 3 1 . 6 拟 合 优 度 检 验 3 1 . 7 列 联 表 独 立 性 检 验 3 2 R 相 关 与 回 归 3 2 . 1 相 关 分 析 3 2 . 1 . 1 相 关 系 数 的 性 质 3 2 . 1 . 2 相 关 与 因 果 3 2 . 1 . 3 相 关 系 数 大 小 3 2 . 1 . 4 相 关 系 数 的 检 验 3 2 . 1 . 5 相 关 阵 3 2 . 1 . 6 S p e a r m a n 秩 相 关 系 数 3 2 . 1 . 7 K e n d a l l t a u 系 数 3 2 . 2 一 元 回 归 分 析 3 2 . 2 . 1 模 型 3 2 . 2 . 2 最 小 二 乘 法 3 2 . 2 . 3 回 归 有 效 性 3 2 . 2 . 4 R 程 序 3 2 . 2 . 5 回 归 诊 断 3 2 . 2 . 6 预 测 区 间 3 2 . 2 . 7 控 制 3 3 R 多 元 回 归 3 3 . 1 模 型 3 3 . 2 参 数 估 计 3 3 . 3 R 的 多 元 回 归 程 序 3 3 . 4 模 型 的 检 验 3 3 . 4 . 1 复 相 关 系 数 平 方 3 3 . 4 . 2 残 差 标 准 误 差 3 3 . 4 . 3 线 性 关 系 检 验 3 3 . 4 . 4 线 性 关 系 检 验 的 功 效 3 3 . 4 . 5 单 个 斜 率 项 的 显 著 性 检 验 3 3 . 5 回 归 自 变 量 筛 选 3 3 . 6 过 度 拟 合 示 例 3 3 . 7 残 差 诊 断 3 3 . 8 多 重 共 线 性 3 3 . 9 强 影 响 点 分 析 3 3 . 1 0 协 方 差 分 析 3 3 . 1 0 . 1 哑 变 量 3 3 . 1 0 . 2 二 值 哑 变 量 与 平 行 线 模 型 3 3 . 1 0 . 3 多 值 哑 变 量 3 3 . 1 1 嵌 套 模 型 的 比 较 3 3 . 1 2 非 嵌 套 模 型 的 比 较 3 3 . 1 3 参 数 线 性 组 合 的 检 验 3 3 . 1 3 . 1 可 估 性 、 对 照 3 3 . 1 3 . 2 t 检 验 法 和 嵌 套 模 型 方 法 3 3 . 1 3 . 3 多 个 对 照 的 检 验 3 3 . 1 4 拟 合 与 预 测 3 3 . 1 4 . 1 拟 合 3 3 . 1 4 . 2 点 预 测 3 3 . 1 4 . 3 均 值 的 置 信 区 间 3 3 . 1 4 . 4 个 别 值 的 预 测 区 间 3 3 . 1 5 利 用 线 性 回 归 模 型 做 曲 线 拟 合 3 3 . 1 6 分 组 建 立 多 个 模 型 3 4 R 公 式 界 面 与 设 计 阵 3 4 . 1 R 语 言 公 式 界 面 3 4 . 1 . 1 公 式 中 的 运 算 符 3 4 . 1 . 2 公 式 中 的 复 合 项 3 4 . 1 . 3 t e r m 类 型 3 4 . 2 R 的 设 计 阵 3 4 . 2 . 1 生 成 模 型 框 3 4 . 2 . 2 模 型 框 中 t e r m s 对 象 的 属 性 3 4 . 2 . 3 模 型 框 中 p o l y 等 变 量 3 4 . 2 . 4 生 成 设 计 阵 3 4 . 3 R 对 照 矩 阵 3 4 . 4 R 信 息 提 取 函 数 3 5 R 非 参 数 回 归 3 5 . 1 模 型 3 5 . 2 样 条 平 滑 3 5 . 3 局 部 多 项 式 曲 线 平 滑 3 5 . 4 样 条 函 数 回 归 3 5 . 5 线 性 可 加 模 型 3 6 R 方 差 分 析 3 6 . 1 单 因 素 方 差 分 析 3 6 . 1 . 1 单 因 素 方 差 分 析 示 例 3 6 . 1 . 2 功 效 与 样 本 量 计 算 3 6 . 1 . 3 多 重 比 较 3 6 . 1 . 4 方 差 不 相 等 情 形 3 6 . 1 . 5 非 参 数 方 差 分 析 3 6 . 2 协 方 差 分 析 3 6 . 3 两 因 素 方 差 分 析 3 6 . 3 . 1 两 因 素 方 差 分 析 计 算 示 例 3 6 . 3 . 2 交 互 作 用 图 3 7 线 性 混 合 模 型 3 7 . 1 介 绍 3 7 . 2 加 权 线 性 回 归 3 7 . 2 . 1 加 权 已 知 情 形 3 7 . 2 . 2 方 差 依 赖 于 均 值 的 情 形 3 7 . 3 线 性 混 合 模 型 3 7 . 3 . 1 问 题 介 绍 3 7 . 3 . 2 理 论 模 型 3 7 . 3 . 3 因 变 量 分 布 3 7 . 3 . 4 估 计 方 法 3 7 . 3 . 5 板 材 摩 擦 力 数 据 建 模 3 7 . 3 . 6 A R M D 数 据 建 模 3 7 . 3 . 7 O r t h o d o n t 数 据 建 模 3 7 . 4 非 线 性 混 合 模 型 介 绍 3 8 广 义 线 性 模 型 3 8 . 1 模 型 3 8 . 1 . 1 介 绍 3 8 . 1 . 2 指 数 族 分 布 3 8 . 2 泊 松 回 归 3 8 . 2 . 1 模 型 3 8 . 2 . 2 最 大 似 然 估 计 3 8 . 2 . 3 偏 差 与 偏 差 分 析 3 8 . 2 . 4 残 差 分 析 3 8 . 2 . 5 菲 律 宾 家 庭 人 数 研 究 案 例 3 8 . 2 . 6 发 病 率 模 型 3 8 . 2 . 7 其 它 问 题 3 8 . 3 逻 辑 斯 谛 回 归 3 8 . 3 . 1 模 型 3 8 . 3 . 2 最 大 似 然 估 计 3 8 . 3 . 3 偏 差 分 析 3 8 . 3 . 4 足 球 罚 球 得 分 概 率 案 例 3 8 . 3 . 5 餐 馆 评 分 问 题 3 8 . 3 . 6 修 建 铁 路 意 见 投 票 情 况 案 例 3 8 . 3 . 7 癌 症 病 人 康 复 概 率 自 变 量 选 择 3 8 . 4 多 水 平 有 序 因 变 量 的 逻 辑 斯 谛 回 归 3 9 R 时 间 序 列 分 析 3 9 . 1 基 本 概 念 3 9 . 2 时 间 序 列 数 据 类 型 3 9 . 2 . 1 t s 类 型 3 9 . 2 . 2 x t s 类 型 与 常 用 函 数 3 9 . 3 基 本 分 析 与 作 图 3 9 . 4 A R I M A 建 模 和 模 拟 3 9 . 4 . 1 模 型 公 式 3 9 . 4 . 2 模 拟 3 9 . 4 . 3 A R 建 模 3 9 . 4 . 4 A R M A 建 模 3 9 . 4 . 5 模 型 诊 断 3 9 . 4 . 6 白 噪 声 检 验 3 9 . 4 . 7 稀 疏 系 数 估 计 3 9 . 4 . 8 单 位 根 检 验 3 9 . 4 . 9 A R M A 模 型 的 一 些 自 定 义 函 数 3 9 . 5 谱 密 度 估 计 3 9 . 6 G A R C H 类 模 型 3 9 . 7 多 元 时 间 序 列 基 础 统 计 3 9 . 8 V A R 模 型 3 9 . 9 协 整 分 析 3 9 . 1 0 因 果 性 检 验 4 0 随 机 模 拟 4 0 . 1 随 机 数 4 0 . 2 s a m p l e ( ) 函 数 4 0 . 3 随 机 模 拟 示 例 4 0 . 3 . 1 估 计 期 望 值 4 0 . 3 . 2 线 性 回 归 模 拟 4 0 . 4 b o o t s t r a p 4 0 . 4 . 1 b o o t 扩 展 包 4 0 . 4 . 2 r s a m p l e 扩 展 包 4 0 . 4 . 3 例 ： 核 密 度 的 b o o t s t r a p 置 信 区 间 4 0 . 5 附 录 ： 完 全 试 验 方 案 设 计 函 数 V I I I 统 计 学 习 4 1 统 计 学 习 介 绍 4 1 . 1 统 计 学 习 的 基 本 概 念 和 方 法 4 1 . 2 偏 差 与 方 差 折 衷 4 1 . 3 交 叉 验 证 4 1 . 4 一 般 步 骤 4 1 . 5 回 归 问 题 的 评 判 指 标 4 1 . 6 判 别 问 题 的 评 判 指 标 4 2 正 则 化 与 惩 罚 回 归 4 2 . 1 介 绍 4 2 . 2 划 分 训 练 集 和 测 试 集 4 2 . 3 回 归 自 变 量 选 择 4 2 . 3 . 1 最 优 子 集 选 择 4 2 . 3 . 2 逐 步 回 归 方 法 4 2 . 3 . 3 预 测 根 均 方 误 差 计 算 4 2 . 3 . 4 用 1 0 折 交 叉 验 证 方 法 选 择 最 优 子 集 4 2 . 4 岭 回 归 4 2 . 4 . 1 用 1 0 折 交 叉 验 证 选 取 调 节 参 数 4 2 . 5 L a s s o 回 归 4 2 . 5 . 1 用 交 叉 验 证 估 计 调 节 参 数 4 2 . 6 附 录 4 2 . 6 . 1 H i t t e r s 数 据 4 3 基 于 树 的 方 法 4 3 . 1 树 回 归 的 简 单 演 示 4 3 . 2 树 回 归 4 3 . 3 装 袋 法 4 3 . 4 随 机 森 林 4 3 . 5 提 升 法 4 3 . 6 心 脏 病 诊 断 建 模 预 报 4 3 . 6 . 1 划 分 训 练 集 与 测 试 集 4 3 . 6 . 2 判 别 树 4 3 . 6 . 3 用 装 袋 法 4 3 . 6 . 4 用 随 机 森 林 4 3 . 7 附 录 4 3 . 7 . 1 H e a r t 数 据 4 4 支 持 向 量 机 4 4 . 1 介 绍 4 4 . 2 支 持 向 量 机 用 于 H e a r t 数 据 4 4 . 2 . 1 线 性 的 S V M 4 4 . 2 . 2 多 项 式 核 S V M 4 4 . 2 . 3 径 向 核 S V M 4 5 用 H 2 O 包 进 行 统 计 学 习 4 5 . 1 介 绍 4 5 . 2 安 装 4 5 . 3 启 动 和 退 出 H 2 O 4 5 . 4 H i t t e r s 数 据 示 例 4 5 . 5 A u t o M L 4 6 整 洁 建 模 基 础 4 6 . 1 建 模 一 般 步 骤 4 6 . 1 . 1 训 练 集 和 测 试 集 的 划 分 4 6 . 2 用 p a r s n i p 建 模 4 6 . 2 . 1 A m e s 数 据 例 子 4 6 . 2 . 2 线 性 回 归 示 例 4 6 . 2 . 3 随 机 森 林 示 例 4 6 . 2 . 4 提 取 拟 合 结 果 4 6 . 2 . 5 预 测 4 6 . 2 . 6 支 持 的 模 型 4 6 . 3 用 w o r k f l o w 管 理 建 模 流 程 4 6 . 3 . 1 工 作 流 程 基 础 4 6 . 3 . 2 指 定 变 量 4 6 . 3 . 3 工 作 流 程 中 公 式 的 作 用 4 6 . 3 . 4 批 量 建 立 工 作 流 程 4 6 . 3 . 5 使 用 测 试 集 4 6 . 4 用 r e c i p e 进 行 特 征 工 程 4 6 . 4 . 1 A m e s 数 据 集 示 例 4 6 . 4 . 2 使 用 食 谱 作 为 预 处 理 4 6 . 4 . 3 典 型 的 预 处 理 4 6 . 4 . 4 对 新 数 据 应 避 免 的 预 处 理 4 6 . 4 . 5 食 谱 的 整 洁 表 示 4 6 . 4 . 6 变 量 的 角 色 4 6 . 4 . 7 更 多 预 处 理 步 骤 4 6 . 5 模 型 效 果 的 评 价 指 标 计 算 4 6 . 5 . 1 模 型 评 估 与 统 计 推 断 4 6 . 5 . 2 回 归 问 题 的 评 估 4 6 . 5 . 3 二 分 类 问 题 的 评 估 4 6 . 5 . 4 多 类 别 分 类 问 题 的 评 估 4 7 整 洁 建 模 中 模 型 调 优 4 7 . 1 用 再 抽 样 技 术 计 算 模 型 评 价 指 标 4 7 . 1 . 1 拟 合 效 果 4 7 . 1 . 2 再 抽 样 方 法 4 7 . 1 . 3 性 能 评 估 4 7 . 1 . 4 利 用 并 行 计 算 功 能 4 7 . 1 . 5 保 存 再 抽 样 建 模 、 预 测 结 果 4 7 . 2 用 再 抽 样 技 术 比 较 模 型 4 7 . 2 . 1 工 作 流 程 集 合 4 7 . 2 . 2 用 再 抽 样 技 术 计 算 的 模 型 性 能 指 标 的 选 择 4 7 . 2 . 3 用 假 设 检 验 比 较 模 型 4 7 . 2 . 4 用 贝 叶 斯 方 法 比 较 模 型 4 7 . 3 模 型 参 数 调 优 和 过 度 拟 合 问 题 4 7 . 3 . 1 概 念 4 7 . 3 . 2 参 数 调 优 的 标 准 4 7 . 3 . 3 超 参 数 选 择 的 问 题 4 7 . 3 . 4 超 参 数 优 化 的 两 种 常 用 策 略 4 7 . 3 . 5 调 优 超 参 数 管 理 4 7 . 4 超 参 数 调 优 的 网 格 搜 索 法 4 7 . 4 . 1 规 则 网 格 与 不 规 则 网 格 4 7 . 4 . 2 评 估 不 同 超 参 数 组 合 的 性 能 4 7 . 4 . 3 确 定 最 优 超 参 数 4 7 . 4 . 4 调 优 工 作 的 辅 助 设 置 参 数 工 具 4 7 . 4 . 5 网 格 搜 索 加 速 工 具 4 7 . 5 超 参 数 调 优 的 迭 代 搜 索 法 4 7 . 5 . 1 支 持 向 量 机 4 7 . 5 . 2 贝 叶 斯 优 化 4 7 . 5 . 3 模 拟 退 火 优 化 4 7 . 6 筛 选 许 多 模 型 4 7 . 6 . 1 混 凝 土 强 度 数 据 建 模 示 例 4 7 . 6 . 2 生 成 工 作 流 程 集 合 4 7 . 6 . 3 模 型 调 优 与 比 较 4 7 . 6 . 4 加 速 模 型 调 优 4 7 . 6 . 5 选 定 最 终 的 模 型 I X 特 殊 应 用 4 8 R 语 言 的 文 本 处 理 4 8 . 1 介 绍 4 8 . 2 字 符 型 常 量 与 字 符 型 向 量 4 8 . 3 字 符 串 连 接 、 重 复 4 8 . 4 格 式 化 输 出 4 8 . 4 . 1 f o r m a t ( ) 函 数 4 8 . 4 . 2 s p r i n t f ( ) 函 数 4 8 . 4 . 3 字 符 串 插 值 函 数 4 8 . 5 字 符 串 长 度 4 8 . 6 取 子 串 4 8 . 7 字 符 串 变 换 4 8 . 7 . 1 大 小 写 4 8 . 7 . 2 字 符 变 换 表 4 8 . 7 . 3 空 白 处 理 4 8 . 7 . 4 截 短 或 分 行 4 8 . 7 . 5 排 序 4 8 . 8 简 单 匹 配 与 查 找 4 8 . 8 . 1 开 头 和 结 尾 匹 配 4 8 . 8 . 2 中 间 匹 配 4 8 . 9 字 符 串 替 换 4 8 . 1 0 字 符 串 拆 分 4 8 . 1 1 文 本 文 件 读 写 4 9 正 则 表 达 式 4 9 . 1 正 则 表 达 式 详 解 4 9 . 1 . 1 字 面 匹 配 与 匹 配 显 示 4 9 . 1 . 2 不 区 分 大 小 写 匹 配 和 r e g e x 函 数 4 9 . 1 . 3 用 句 点 匹 配 单 个 字 符 4 9 . 1 . 4 匹 配 一 组 字 符 中 的 某 一 个 4 9 . 1 . 5 原 样 匹 配 元 字 符 4 9 . 1 . 6 匹 配 某 类 字 符 4 9 . 1 . 7 备 择 模 式 4 9 . 1 . 8 匹 配 开 头 和 末 尾 4 9 . 1 . 9 单 词 边 界 4 9 . 1 . 1 0 重 复 匹 配 4 9 . 1 . 1 1 贪 婪 匹 配 和 懒 惰 匹 配 4 9 . 1 . 1 2 允 许 句 点 匹 配 换 行 4 9 . 1 . 1 3 多 行 模 式 4 9 . 1 . 1 4 逐 行 处 理 4 9 . 1 . 1 5 替 换 4 9 . 1 . 1 6 分 组 与 捕 获 4 9 . 1 . 1 7 在 数 据 框 中 拆 分 列 4 9 . 2 s t r i n g r 包 的 正 则 表 达 式 函 数 4 9 . 2 . 1 s t r _ v i e w ( ) 函 数 4 9 . 2 . 2 r e g e x ( ) 函 数 4 9 . 2 . 3 构 造 复 杂 的 模 式 4 9 . 2 . 4 检 查 哪 些 元 素 能 够 匹 配 4 9 . 2 . 5 计 数 模 式 匹 配 次 数 4 9 . 2 . 6 返 回 匹 配 的 元 素 或 元 素 序 号 4 9 . 2 . 7 提 取 匹 配 内 容 4 9 . 2 . 8 提 取 分 组 捕 获 内 容 4 9 . 2 . 9 定 位 匹 配 位 置 4 9 . 3 附 录 ： 利 用 基 本 R 函 数 进 行 正 则 表 达 式 处 理 4 9 . 3 . 1 不 区 分 大 小 写 匹 配 4 9 . 3 . 2 匹 配 单 个 字 符 4 9 . 3 . 3 匹 配 一 组 字 符 中 的 某 一 个 4 9 . 3 . 4 原 样 匹 配 元 字 符 4 9 . 3 . 5 匹 配 数 字 4 9 . 3 . 6 匹 配 开 头 和 末 尾 4 9 . 3 . 7 匹 配 字 母 、 数 字 、 下 划 线 4 9 . 3 . 8 十 六 进 制 和 八 进 制 数 4 9 . 3 . 9 P O S I X 字 符 类 4 9 . 3 . 1 0 加 号 重 复 匹 配 4 9 . 3 . 1 1 星 号 和 问 号 重 复 匹 配 4 9 . 3 . 1 2 计 数 重 复 4 9 . 3 . 1 3 贪 婪 匹 配 和 懒 惰 匹 配 4 9 . 3 . 1 4 单 词 边 界 4 9 . 3 . 1 5 句 点 全 匹 配 与 多 行 模 式 4 9 . 3 . 1 6 备 择 模 式 4 9 . 3 . 1 7 分 组 与 捕 获 5 0 文 本 应 用 5 0 . 1 正 则 表 达 式 应 用 例 子 5 0 . 1 . 1 数 据 预 处 理 5 0 . 1 . 2 不 规 则 E x c e l 文 件 处 理 5 0 . 1 . 3 字 频 统 计 5 0 . 1 . 4 数 字 验 证 5 0 . 1 . 5 文 件 名 中 的 数 字 提 取 5 0 . 2 网 站 数 据 获 取 5 0 . 3 中 文 分 词 与 词 云 5 1 数 据 库 访 问 5 1 . 1 介 绍 5 1 . 2 S Q L i t e 数 据 库 访 问 5 1 . 2 . 1 N H A N E S 数 据 5 1 . 2 . 2 初 始 化 新 S Q L i t e 数 据 库 5 1 . 2 . 3 查 看 数 据 库 中 的 表 5 1 . 2 . 4 读 入 数 据 库 中 的 表 5 1 . 2 . 5 用 S Q L 命 令 访 问 数 据 5 1 . 2 . 6 分 批 读 入 数 据 库 中 的 表 5 1 . 2 . 7 关 闭 数 据 库 连 接 5 1 . 2 . 8 其 它 数 据 库 操 作 5 1 . 3 d u c k d b 数 据 库 访 问 5 1 . 4 用 d b p l y r 包 访 问 数 据 库 5 1 . 5 S Q L 命 令 简 介 5 1 . 5 . 1 取 行 子 集 5 1 . 5 . 2 取 行 列 子 集 5 1 . 5 . 3 取 某 列 的 所 有 不 同 取 值 5 1 . 5 . 4 查 询 结 果 排 序 5 1 . 5 . 5 查 询 时 计 算 新 变 量 5 1 . 5 . 6 分 组 汇 总 5 1 . 5 . 7 将 查 询 结 果 保 存 为 新 表 5 1 . 5 . 8 从 多 个 表 查 询 5 1 . 6 用 d m 包 管 理 表 5 1 . 7 访 问 O r a c l e 数 据 库 5 1 . 8 M y S Q L 数 据 库 访 问 5 1 . 9 利 用 R O D B C 访 问 A c c e s s 数 据 库 5 1 . 1 0 a r r o w 包 5 1 . 1 1 层 次 数 据 5 1 . 1 1 . 1 嵌 套 列 表 5 1 . 1 1 . 2 t i b b l e 中 的 列 表 5 1 . 1 1 . 3 展 开 示 例 5 1 . 1 1 . 4 J S O N 格 式 X 用 R c p p 访 问 C + + 代 码 5 2 R c p p 介 绍 5 2 . 1 R c p p 的 用 途 5 2 . 2 R c p p 入 门 样 例 5 2 . 2 . 1 用 e v a l C p p ( ) 转 换 单 一 计 算 表 达 式 5 2 . 2 . 2 用 c p p F u n c t i o n ( ) 转 换 简 单 的 C + + 函 数 — F i b n a c c i 例 子 5 2 . 2 . 3 用 s o u r c e C p p ( ) 转 换 C + + 程 序 — 正 负 交 替 迭 代 例 子 5 2 . 2 . 4 用 s o u r c e C p p ( ) 转 换 C + + 源 文 件 中 的 程 序 — 正 负 交 替 迭 代 例 子 5 2 . 2 . 5 用 s o u r c e C p p ( ) 转 换 C + + 源 程 序 文 件 — 卷 积 例 子 5 2 . 2 . 6 随 机 数 例 子 5 2 . 2 . 7 b o o t s t r a p 例 子 5 2 . 2 . 8 在 R m d 文 件 中 使 用 C + + 源 程 序 文 件 5 3 R 与 C + + 的 类 型 转 换 5 3 . 1 用 w r a p ( ) 把 C + + 变 量 返 回 到 R 中 5 3 . 2 用 a s ( ) 函 数 把 R 变 量 转 换 为 C + + 类 型 5 3 . 3 a s ( ) 和 w r a p ( ) 的 隐 含 调 用 5 4 R c p p 属 性 5 4 . 1 R c p p 属 性 介 绍 5 4 . 2 在 C + + 源 程 序 中 指 定 要 导 出 的 C + + 函 数 5 4 . 2 . 1 特 殊 注 释 / / [ [ R c p p : : e x p o r t ] ] 5 4 . 2 . 2 修 改 导 出 的 函 数 名 5 4 . 2 . 3 可 导 出 的 函 数 5 4 . 3 在 R 中 编 译 链 接 C + + 代 码 5 4 . 3 . 1 s o u r c e C p p ( ) 函 数 中 直 接 包 含 C + + 源 程 序 字 符 串 5 4 . 3 . 2 c p p F u n c t i o n ( ) 函 数 中 直 接 包 含 C + + 函 数 源 程 序 字 符 串 5 4 . 3 . 3 e v a l C p p ( ) 函 数 中 直 接 包 含 C + + 源 程 序 表 达 式 字 符 串 5 4 . 3 . 4 用 d e p e n d s 指 定 要 链 接 的 库 5 4 . 4 R c p p 属 性 的 其 它 功 能 5 4 . 4 . 1 自 变 量 有 缺 省 值 的 函 数 5 4 . 4 . 2 异 常 传 递 5 4 . 4 . 3 允 许 用 户 中 断 5 4 . 4 . 4 把 R 代 码 写 在 C + + 源 文 件 中 5 4 . 4 . 5 用 i n v i s i b l e 要 求 函 数 结 果 不 自 动 显 示 5 4 . 4 . 6 在 C + + 中 调 用 R 的 随 机 数 发 生 器 5 5 R c p p 提 供 的 C + + 数 据 类 型 5 5 . 1 R O b j e c t 类 5 5 . 2 I n t e g e r V e c t o r 类 5 5 . 2 . 1 I n t e g e r V e c t o r 示 例 1 ： 返 回 完 全 数 5 5 . 2 . 2 I n t e g e r V e c t o r 示 例 2 ： 输 入 整 数 向 量 5 5 . 3 N u m e r i c V e c t o r 类 5 5 . 3 . 1 示 例 1 ： 计 算 元 素 \ \ ( p \ \ ) 次 方 的 和 5 5 . 3 . 2 示 例 2 ： c l o n e 函 数 5 5 . 3 . 3 示 例 3 ： 向 量 子 集 5 5 . 4 N u m e r i c M a t r i x 类 5 5 . 4 . 1 示 例 1 ： 计 算 矩 阵 各 列 模 的 最 大 值 5 5 . 4 . 2 示 例 2 ： 把 输 入 矩 阵 制 作 副 本 计 算 元 素 平 方 根 5 5 . 4 . 3 示 例 3 ： 访 问 列 子 集 5 5 . 5 R c p p 的 其 它 向 量 类 5 5 . 5 . 1 R c p p 的 L o g i c a l V e c t o r 类 5 5 . 5 . 2 R c p p 的 C h a r a c t e r V e c t o r 类 型 5 5 . 6 R c p p 提 供 的 其 它 数 据 类 型 5 5 . 6 . 1 N a m e d 类 型 5 5 . 6 . 2 L i s t 类 型 5 5 . 6 . 3 R c p p 的 D a t a F r a m e 类 5 5 . 6 . 4 R c p p 的 F u n c t i o n 类 5 5 . 6 . 5 R c p p 的 E n v i r o n m e n t 类 5 6 R c p p 糖 5 6 . 1 简 单 示 例 5 6 . 2 向 量 化 的 运 算 符 5 6 . 2 . 1 向 量 化 的 四 则 运 算 5 6 . 2 . 2 向 量 化 的 赋 值 运 算 5 6 . 2 . 3 向 量 化 的 二 元 逻 辑 运 算 5 6 . 2 . 4 向 量 化 的 一 元 运 算 符 5 6 . 3 用 R c p p 访 问 数 学 函 数 5 6 . 4 用 R c p p 访 问 统 计 分 布 类 函 数 5 6 . 5 在 R c p p 中 产 生 随 机 数 5 6 . 6 返 回 单 一 逻 辑 值 的 函 数 5 6 . 7 返 回 糖 表 达 式 的 函 数 5 6 . 7 . 1 i s _ n a 5 6 . 7 . 2 s e q _ a l o n g 5 6 . 7 . 3 s e q _ l e n 5 6 . 7 . 4 p m i n 和 p m a x 5 6 . 7 . 5 i f e l s e 5 6 . 7 . 6 s a p p l y 和 l a p p l y 5 6 . 7 . 7 s i g n 5 6 . 7 . 8 d i f f 5 6 . 8 R 与 R c p p 不 同 语 法 示 例 5 6 . 9 用 R c p p A r m a d i l l o 执 行 矩 阵 运 算 5 6 . 9 . 1 生 成 多 元 正 态 分 布 随 机 数 5 6 . 9 . 2 快 速 计 算 线 性 回 归 5 7 用 R c p p 帮 助 制 作 R 扩 展 包 5 7 . 1 不 用 扩 展 包 共 享 C + + 代 码 的 方 法 5 7 . 2 生 成 扩 展 包 5 7 . 2 . 1 利 用 已 有 基 于 R c p p 属 性 的 源 程 序 制 作 扩 展 包 5 7 . 2 . 2 D E S C R I P T I O N 文 件 5 7 . 2 . 3 N A M E S P A C E 文 件 5 7 . 3 重 新 编 译 5 7 . 4 建 立 C + + 用 的 接 口 界 面 X I 其 它 5 8 R 编 程 例 子 5 8 . 1 R 语 言 5 8 . 1 . 1 用 向 量 作 逆 变 换 5 8 . 1 . 2 斐 波 那 契 数 列 计 算 5 8 . 1 . 3 穷 举 所 有 排 列 5 8 . 1 . 4 可 重 复 分 组 方 式 穷 举 5 8 . 1 . 5 升 降 连 计 数 5 8 . 1 . 6 高 斯 八 皇 后 问 题 5 8 . 1 . 7 最 小 能 量 路 径 5 8 . 2 概 率 5 8 . 2 . 1 智 者 千 虑 必 有 一 失 5 8 . 2 . 2 圆 桌 夫 妇 座 位 问 题 5 8 . 3 科 学 计 算 5 8 . 3 . 1 城 市 间 最 短 路 径 5 8 . 3 . 2 D a u b e c h i e s 小 波 函 数 计 算 5 8 . 3 . 3 房 间 加 热 温 度 变 化 5 8 . 4 统 计 计 算 5 8 . 4 . 1 线 性 回 归 实 例 5 8 . 4 . 2 核 回 归 与 核 密 度 估 计 5 8 . 4 . 3 二 维 随 机 模 拟 积 分 5 8 . 4 . 4 潜 周 期 估 计 5 8 . 4 . 5 A R M A ( 1 , 1 ) 模 型 估 计 5 8 . 4 . 6 V A R 模 型 平 稳 性 5 8 . 4 . 7 贮 存 可 靠 性 评 估 5 8 . 5 数 据 处 理 5 8 . 5 . 1 小 题 分 题 型 分 数 汇 总 5 8 . 5 . 2 类 别 编 号 重 排 5 8 . 6 文 本 处 理 5 8 . 6 . 1 用 R 语 言 下 载 处 理 《 红 楼 梦 》 h t m 文 件 5 9 使 用 经 验 5 9 . 1 文 件 管 理 5 9 . 1 . 1 工 作 空 间 5 9 . 2 程 序 格 式 附 录 A R M a r k d o w n 文 件 格 式 A . 1 R M a r k d o w n 文 件 A . 2 R M a r k d o w n 文 件 的 编 译 A . 2 . 1 编 译 的 实 际 过 程 A . 3 在 R M a r k d o w n 文 件 中 插 入 R 代 码 A . 4 输 出 表 格 A . 5 利 用 R 程 序 插 图 A . 6 冗 余 输 出 控 制 A . 7 代 码 段 选 项 A . 7 . 1 代 码 和 文 本 输 出 结 果 格 式 A . 7 . 2 图 形 选 项 A . 7 . 3 缓 存 ( c a c h e ) 选 项 A . 8 章 节 目 录 链 接 问 题 A . 9 其 它 编 程 语 言 引 擎 A . 1 0 交 互 内 容 A . 1 1 属 性 设 置 A . 1 1 . 1 Y A M L 元 数 据 A . 1 1 . 2 输 出 格 式 A . 1 1 . 3 输 出 格 式 设 置 A . 1 1 . 4 目 录 设 置 A . 1 1 . 5 章 节 自 动 编 号 A . 1 1 . 6 W o r d 输 出 章 节 自 动 编 号 及 模 板 功 能 A . 1 1 . 7 H T M L 特 有 输 出 格 式 设 置 A . 1 1 . 8 关 于 数 学 公 式 支 持 的 设 置 A . 1 1 . 9 输 出 设 置 文 件 A . 1 2 L a T e X 和 P D F 输 出 A . 1 2 . 1 T i n y T e x 的 安 装 使 用 A . 1 2 . 2 R m d 中 L a t e x 设 置 A . 1 3 生 成 期 刊 文 章 A . 1 4 附 录 ： 经 验 与 问 题 A . 1 4 . 1 W o r d 模 板 制 作 A . 1 4 . 2 数 学 公 式 设 置 补 充 B 用 b o o k d o w n 制 作 图 书 B . 1 介 绍 B . 2 一 本 书 的 设 置 B . 3 章 节 结 构 B . 4 书 的 编 译 B . 5 交 叉 引 用 B . 6 数 学 公 式 和 公 式 编 号 B . 7 定 理 类 编 号 B . 8 文 献 引 用 B . 9 插 图 B . 1 0 表 格 B . 1 0 . 1 M a r k d o w n 表 格 B . 1 0 . 2 用 k a b l e ( ) 函 数 制 作 表 格 B . 1 0 . 3 R 中 其 它 制 作 表 格 的 包 B . 1 1 数 学 公 式 的 设 置 B . 1 2 使 用 经 验 B . 1 2 . 1 学 位 论 文 B . 1 2 . 2 L a T e X B . 1 2 . 3 算 法 B . 1 2 . 4 中 文 乱 码 B . 1 2 . 5 图 片 格 式 B . 1 2 . 6 其 它 经 验 B . 1 3 b o o k d o w n 的 一 些 使 用 问 题 C 用 R M a r k d o w n 制 作 简 易 网 站 C . 1 介 绍 C . 2 简 易 网 站 制 作 C . 2 . 1 网 站 结 构 C . 2 . 2 编 译 C . 2 . 3 内 容 文 件 C . 2 . 4 网 站 设 置 C . 3 用 b l o g d o w n 制 作 网 站 C . 3 . 1 生 成 新 网 站 的 框 架 C . 3 . 2 网 页 内 容 文 件 及 其 设 置 C . 3 . 3 初 学 者 的 工 作 流 程 C . 3 . 4 网 站 设 置 文 件 C . 3 . 5 静 态 文 件 D 制 作 幻 灯 片 D . 1 介 绍 D . 2 S l i d y 幻 灯 片 D . 2 . 1 文 件 格 式 D . 2 . 2 幻 灯 片 编 译 D . 2 . 3 播 放 控 制 D . 2 . 4 生 成 单 页 H T M L D . 2 . 5 数 学 公 式 处 理 与 输 出 设 置 文 件 D . 2 . 6 其 它 选 项 D . 2 . 7 s l i d y 幻 灯 片 激 光 笔 失 效 问 题 的 修 改 D . 3 M S P o w e r P o i n t 幻 灯 片 D . 4 B e a r m e r 幻 灯 片 格 式 D . 5 R P r e s e n t a t i o n 格 式 R e f e r e n c e s 编 著 ： 李 东 风 R 语 言 教 程 1 R 语 言 介 绍 1 . 1 R 的 历 史 和 特 点 1 . 1 . 1 R 的 历 史 R 语 言 来 自 S 语 言 ， 是 S 语 言 的 一 个 变 种 。 S 语 言 由 R i c k B e c k e r , J o h n C h a m b e r s , A l a n W i l k s 等 人 在 贝 尔 实 验 室 开 发 ， 著 名 的 C 语 言 、 U n i x 系 统 也 是 贝 尔 实 验 室 开 发 的 。 S 语 言 第 一 个 版 本 开 发 于 1 9 7 6 1 9 8 0 ， 基 于 F o r t r a n ； 于 1 9 8 0 年 移 植 到 U n i x , 并 对 外 发 布 源 代 码 。 1 9 8 4 年 出 版 的 “ 棕 皮 书 ” ( R . A . B e c k e r a n d C h a m b e r s 1 9 8 4 ) 总 结 了 1 9 8 4 年 为 止 的 版 本 , 并 开 始 发 布 授 权 的 源 代 码 。 这 个 版 本 叫 做 旧 S ， 与 我 们 现 在 用 的 S 语 言 ( R 语 言 ) 有 较 大 差 别 ， 比 如 ， 不 支 持 自 定 义 函 数 。 1 9 8 4 – 1 9 8 8 对 S 进 行 了 较 大 更 新 ， 变 成 了 我 们 现 在 使 用 的 S 语 言 ， 称 为 第 二 版 。 1 9 8 8 年 出 版 的 “ 蓝 皮 书 ” ( R i c h a r d A . B e c k e r , C h a m b e r s , a n d W i l k s 1 9 8 8 ) 做 了 总 结 。 1 9 9 2 年 出 版 的 “ 白 皮 书 ” ( J . M . C h a m b e r s a n d H a s t i e 1 9 9 2 ) 描 述 了 在 S 语 言 中 实 现 的 统 计 建 模 功 能 ， 增 强 了 面 向 对 象 的 特 性 。 软 件 称 为 第 三 版 ， 这 是 我 们 现 在 用 的 多 数 版 本 。 1 9 9 8 年 出 版 的 “ 绿 皮 书 ” ( J o h n M . C h a m b e r s 1 9 9 8 ) 描 述 了 第 四 版 S 语 言 ， 主 要 是 编 程 功 能 的 深 层 次 改 进 。 现 行 的 S 系 统 并 没 有 都 采 用 第 四 版 ， S P L U S 的 第 5 版 才 采 用 了 S 语 言 第 四 版 。 S 语 言 商 业 版 本 为 S P L U S , 1 9 8 8 年 发 布 ， 现 在 为 T i b c o S o f t w a r e 拥 有 。 命 运 多 舛 ， 多 次 易 主 。 现 在 已 经 基 本 被 R 语 言 取 代 。 R 是 一 个 自 由 源 代 码 软 件 ， G P L 授 权 ， 最 初 由 新 西 兰 A u c k l a n d 大 学 的 R o s s I h a k a 和 R o b e r t G e n t l e m a n 于 1 9 9 7 年 发 布 ， R 实 现 了 与 S 语 言 基 本 相 同 的 功 能 和 统 计 功 能 。 现 在 由 R 核 心 团 队 开 发 ， 但 全 世 界 的 用 户 都 可 以 贡 献 软 件 包 。 R 的 网 站 : h t t p : / / w w w . r p r o j e c t . o r g / 1 . 1 . 2 R 的 特 点 1 . 1 . 2 . 1 R 语 言 一 般 特 点 自 由 软 件 ， 免 费 、 开 放 源 代 码 ， 支 持 各 个 主 要 计 算 机 系 统 ； 完 整 的 程 序 设 计 语 言 ， 基 于 函 数 和 对 象 ， 可 以 自 定 义 函 数 ， 调 入 C 、 C + + 、 F o r t r a n 编 译 的 代 码 ； 具 有 完 善 的 数 据 类 型 ， 如 向 量 、 矩 阵 、 因 子 、 数 据 集 、 一 般 对 象 等 ， 支 持 缺 失 值 ， 代 码 像 伪 代 码 一 样 简 洁 、 可 读 ; 强 调 交 互 式 数 据 分 析 ， 支 持 复 杂 算 法 描 述 ， 图 形 功 能 强 ; 实 现 了 经 典 的 、 现 代 的 统 计 方 法 ， 如 参 数 和 非 参 数 假 设 检 验 、 线 性 回 归 、 广 义 线 性 回 归 、 非 线 性 回 归 、 可 加 模 型 、 树 回 归 、 混 合 模 型 、 方 差 分 析 、 判 别 、 聚 类 、 时 间 序 列 分 析 等 。 统 计 科 研 工 作 者 广 泛 使 用 R 进 行 计 算 和 发 表 算 法 。 R 有 上 万 扩 展 包 ( 截 止 2 0 2 3 年 4 月 在 R 扩 展 包 主 要 分 发 网 站 C R A N 上 有 一 万 九 千 多 个 ) 。 1 . 1 . 2 . 2 R 语 言 和 R 软 件 的 技 术 特 点 S 语 言 作 者 ， R 语 言 专 家 J . M . C h a m b e r s ( ( J . M . C h a m b e r s 2 0 1 6 ) ) 指 出 R 的 本 质 特 征 ： R 中 所 有 的 存 在 都 是 对 象 ； R 中 发 生 的 动 作 都 是 函 数 调 用 。 详 细 地 说 R 有 如 下 技 术 特 点 ： 函 数 编 程 （ f u n c t i o n a l p r o g r a m m i n g ） 。 R 语 言 虽 然 不 是 严 格 的 f u n c t i o n a l p r o g r a m m i n g 语 言 ， 但 可 以 遵 照 其 原 则 编 程 ， 得 到 可 验 证 的 可 靠 程 序 。 支 持 对 象 类 和 类 方 法 。 基 于 对 象 的 程 序 设 计 。 是 动 态 类 型 语 言 ， 解 释 执 行 ， 运 行 速 度 较 慢 。 数 据 框 是 基 本 的 观 测 数 据 类 型 ， 类 似 于 数 据 库 的 表 。 开 源 软 件 （ O p e n s o u r c e s o f t w a r e ） 。 可 深 入 探 查 ， 开 发 者 和 用 户 交 互 。 可 以 用 作 C 和 C + + 、 F O R T R A N 语 言 编 写 的 算 法 库 的 接 口 。 主 要 数 值 算 法 采 用 已 广 泛 测 试 和 采 纳 的 算 法 实 现 ， 如 排 序 、 随 机 数 生 成 、 线 性 代 数 （ L A P A C K 软 件 包 ） 。 1 . 2 参 考 资 料 1 . 2 . 1 推 荐 参 考 书 H a d l e y W i c k h a m a n d G a r r e t t G r o l e m u n d ( 2 0 2 2 ) . R f o r D a t a S c i e n c e ， h t t p s : / / r 4 d s . h a d l e y . n z / , 2 n d e d . 讲 基 本 的 数 据 整 理 、 汇 总 。 H a d l e y W i c k h a m ( 2 0 1 9 ) . A d v a n c e d R , 2 n d e d . , h t t p s : / / a d v r . h a d l e y . n z / , C h a p m a n d e v t o o l s ) d e v t o o l s : : i n s t a l l _ g i t h u b ( k j h e a l y / s o c v i z ) 其 中 k j h e a l y 是 G i t h u b 网 站 的 某 个 作 者 的 名 称 ， s o c v i z 是 该 作 者 名 下 的 一 个 R 扩 展 包 。 还 有 一 些 包 需 要 从 B i o c o n d u c t o r 网 站 安 装 ， 可 利 用 镜 像 网 站 。 利 用 清 华 大 学 镜 像 的 示 例 如 下 ： o p t i o n s ( r e p o s = c ( C R A N = h t t p s : / / m i r r o r . t u n a . t s i n g h u a . e d u . c n / C R A N / ) ) i f ( ! r e q u i r e N a m e s p a c e ( B i o c M a n a g e r , q u i e t l y = T R U E ) ) o p t i o n s ( B i o C _ m i r r o r = h t t p s : / / m i r r o r s . t u n a . t s i n g h u a . e d u . c n / b i o c o n d u c t o r ) B i o c M a n a g e r : : i n s t a l l ( c ( B i o s t r i n g s ) ) 随 后 安 装 B i o c o n d u c t o r 的 其 它 包 ， 也 应 该 先 设 置 r e p o s 和 B i o c _ m i r r o r 选 项 。 1 . 4 . 4 更 新 扩 展 包 在 R S t u d i o 中 用 “ T o o l s – C h e c k f o r P a c k a g e U p d a t e s ” 菜 单 ， 可 以 显 示 有 新 版 本 的 扩 展 包 ， 并 选 择 进 行 更 新 。 或 者 在 命 令 行 用 如 下 命 令 更 新 本 地 安 装 的 所 有 有 新 版 本 的 C R A N 扩 展 包 ： o p t i o n s ( r e p o s = c ( C R A N = h t t p : / / m i r r o r . t u n a . t s i n g h u a . e d u . c n / C R A N / ) ) u p d a t e . p a c k a g e s ( c h e c k B u i l t = T R U E , a s k = F A L S E ) R S t u d i o 在 运 行 时 会 载 入 某 些 包 ， 如 r l a n g ， 这 使 得 R S t u d i o 无 法 更 新 这 些 包 ， 需 要 在 R 的 命 令 行 程 序 （ 就 是 基 本 R 软 件 ） 中 更 新 。 1 . 4 . 5 迁 移 扩 展 包 在 每 一 次 R 软 件 更 新 后 ， 需 要 重 新 安 装 原 来 的 软 件 包 ， 这 个 过 程 很 麻 烦 。 如 果 仅 仅 是 小 的 版 本 更 新 ， 比 如 从 3 . 5 . 1 变 成 3 . 5 . 2 ， 或 者 从 3 . 4 . 2 变 成 3 . 5 . 0 ， 可 以 在 安 装 新 版 本 后 ， 临 时 将 新 版 本 的 l i b r a r y 子 目 录 更 名 为 l i b r a r y 0 ， 将 老 版 本 的 l i b r a r y 子 目 录 剪 切 为 新 版 本 的 l i b r a r y 子 目 录 ， 然 后 将 l i b r a r y 0 中 所 有 内 容 复 制 并 覆 盖 进 入 l i b r a r y 子 目 录 ， 删 除 l i b r a r y 0 即 可 。 然 后 在 基 本 R 中 （ 不 要 用 R S t u d i o ） 运 行 如 下 命 令 以 更 新 有 新 版 本 的 包 ： o p t i o n s ( r e p o s = c ( C R A N = h t t p : / / m i r r o r . t u n a . t s i n g h u a . e d u . c n / C R A N / ) ) u p d a t e . p a c k a g e s ( c h e c k B u i l t = T R U E , a s k = F A L S E ) 如 果 版 本 改 变 比 较 大 ， 可 以 用 如 下 方 法 批 量 地 重 新 安 装 原 有 的 软 件 包 。 首 先 ， 在 更 新 R 软 件 前 ， 在 原 来 的 R 中 运 行 ： p a c k a g e s . p a c k a g e s ( T R U E ) d u m p ( p a c k a g e s , f i l e = p a c k a g e s 2 0 1 8 0 7 0 4 . R ) 这 样 可 以 获 得 要 安 装 的 软 件 包 的 列 表 。 在 更 新 R 软 件 后 ， 运 行 如 下 程 序 ： o p t i o n s ( r e p o s = c ( C R A N = h t t p : / / m i r r o r . t u n a . t s i n g h u a . e d u . c n / C R A N / ) ) s o u r c e ( p a c k a g e s 2 0 1 8 0 7 0 4 . R ) i n s t a l l . p a c k a g e s ( p a c k a g e s ) 安 装 时 如 果 提 问 是 否 安 装 需 要 编 译 的 源 代 码 包 ， 最 好 选 择 否 ， 因 为 安 装 源 代 码 包 速 度 很 慢 还 有 可 能 失 败 。 1 . 4 . 6 项 目 私 有 扩 展 包 目 录 在 使 用 了 R 一 段 较 长 时 间 以 后 ， 会 安 装 了 许 多 扩 展 包 ， 这 些 扩 展 包 在 某 个 时 期 是 有 用 的 ， 但 是 一 旦 某 个 任 务 完 成 了 就 不 再 有 用 。 但 是 ， 用 户 自 己 无 法 判 断 哪 些 包 已 经 不 需 要 。 R 的 r e n v 扩 展 包 支 持 每 个 项 目 保 存 私 有 的 扩 展 包 目 录 ， 这 样 ， 不 同 的 项 目 使 用 不 同 的 扩 展 包 集 合 ， 不 至 于 引 发 版 本 冲 突 ， 也 不 必 总 是 为 公 用 的 R 扩 展 包 目 录 增 加 许 多 仅 是 短 暂 使 用 的 扩 展 包 。 用 r e n v 管 理 项 目 私 有 扩 展 包 目 录 ， 也 有 利 于 将 项 目 迁 移 到 其 它 电 脑 中 ， 并 且 保 证 每 次 使 用 的 扩 展 包 版 本 号 不 变 ， 避 免 多 个 项 目 共 用 的 扩 展 包 升 级 造 成 兼 容 性 问 题 。 那 些 不 需 要 安 装 许 多 扩 展 包 的 项 目 仍 可 以 不 启 用 r e n v ， 使 用 公 用 的 R 扩 展 包 目 录 。 在 生 成 新 的 R S t u d i o 项 目 时 ， 可 以 点 击 选 中 “ U s e r e n v w i t h t h i s p r o j e c t ” 复 选 框 ； 对 已 有 的 R S t d i o 项 目 ， 如 果 要 启 用 r e n v ， 可 以 选 菜 单 “ T o o l s – P r o j e c t O p t i o n s – E n v i r o n m e n t ” ， 选 中 “ U s e r e n v w i t h t h i s p r o j e c t ” 复 选 框 。 启 用 了 r e n v 的 项 目 ， 在 安 装 新 的 扩 展 包 时 ， 将 安 装 在 项 目 目 录 中 ， 而 不 再 修 改 R 的 公 用 的 扩 展 包 目 录 。 这 也 有 助 于 将 项 目 迁 移 到 其 它 计 算 机 上 。 1 . 5 基 本 R 软 件 的 用 法 1 . 5 . 1 基 本 运 行 在 M S W i n d o w s 操 作 系 统 中 的 R 软 件 有 一 个 R G U I 软 件 ， 即 图 形 窗 口 模 式 的 R 软 件 ， 如 图 1 . 1 。 图 1 . 1 : R G U I 截 图 R G U I 中 有 一 个 命 令 行 窗 口 ( R C o n s o l e ) ， 以 大 于 号 为 提 示 符 ， 在 提 示 符 后 面 键 入 命 令 ， 命 令 的 文 字 型 结 果 马 上 显 示 在 命 令 下 方 ， 命 令 的 图 形 结 果 单 独 显 示 在 一 个 图 形 窗 口 中 。 在 命 令 行 可 以 通 过 左 右 光 标 键 移 动 光 标 到 适 当 位 置 进 行 修 改 。 可 以 用 上 下 光 标 在 已 经 运 行 过 的 历 史 命 令 中 切 换 ， 调 回 已 经 运 行 过 的 命 令 ， 修 改 后 重 新 执 行 。 如 果 某 个 文 件 如 m y p r o g . R 在 当 前 工 作 目 录 中 ， 保 存 的 都 是 R 程 序 ， 称 这 样 的 文 件 为 源 程 序 文 件 。 可 以 在 命 令 行 用 如 下 命 令 运 行 其 中 的 程 序 ： s o u r c e ( m y p r o g . R ) 但 是 ， 在 M S W i n d o w s 操 作 系 统 中 ， 默 认 的 中 文 编 码 是 G B 1 8 0 3 0 编 码 。 R 源 程 序 文 件 的 中 文 编 码 可 能 是 G B 1 8 0 3 0 也 可 能 是 U T F 8 。 U T F 8 是 在 世 界 范 围 更 通 用 的 编 码 。 如 果 发 现 用 上 述 命 令 运 行 时 出 现 中 文 乱 码 ， 可 能 是 因 为 源 程 序 用 了 U T F 8 编 码 ， 这 时 s o u r c e ( ) 命 令 要 加 上 编 码 选 项 如 下 ： s o u r c e ( m y p r o g . R , e n c o d i n g = U T F 8 ) 1 . 5 . 2 项 目 目 录 用 R 进 行 数 据 分 析 ， 不 同 的 分 析 问 题 需 要 放 在 不 同 的 文 件 夹 中 。 以 M S W i n d o w s 操 作 系 统 为 例 ， 设 某 个 分 析 问 题 的 数 据 与 程 序 放 在 了 c : \ \ w o r k 文 件 夹 中 。 把 R 的 快 捷 方 式 从 桌 面 复 制 入 此 文 件 夹 ， 在 W i n d o w s 资 源 管 理 器 中 ， 右 键 单 击 此 快 捷 方 式 ， 在 弹 出 菜 单 中 选 “ 属 性 ” ， 把 “ 快 捷 方 式 ” 页 面 的 “ 起 始 位 置 ” 的 内 容 清 除 为 空 白 ， 把 “ 目 标 ” 的 内 容 中 的 c d t o u s e r d o c s 删 去 ， 点 击 确 定 按 钮 。 启 动 在 w o r k 文 件 夹 中 的 R 快 捷 方 式 ， 出 现 命 令 行 界 面 。 这 时 ， C : \ \ w o r k 称 为 当 前 工 作 目 录 。 在 命 令 行 运 行 如 下 命 令 可 以 显 示 当 前 工 作 目 录 位 置 ： g e t w d ( ) # # C : / w o r k 显 示 结 果 中 的 目 录 、 子 目 录 、 文 件 之 间 的 分 隔 符 用 了 / 符 号 ， 在 W i n d o w s 操 作 系 统 中 一 般 应 该 使 用 \ \ \ \ 符 号 ， 但 是 ， 在 R 的 字 符 串 中 一 个 \ \ 需 要 写 成 两 个 ， 所 以 等 价 的 写 法 是 C : \ \ \ \ w o r k 。 不 同 的 分 析 项 目 需 要 存 放 在 不 同 的 文 件 夹 中 ， 每 个 文 件 夹 都 放 置 一 个 “ 起 始 位 置 ” 为 空 的 R 快 捷 方 式 图 标 ， 分 析 哪 一 个 项 目 ， 就 从 对 应 的 快 捷 图 标 启 动 ， 而 不 是 从 桌 面 上 的 R 图 标 启 动 。 这 样 做 的 好 处 是 ， 用 到 源 文 件 和 数 据 文 件 时 ， 只 要 文 件 在 该 项 目 的 文 件 夹 中 ， 就 不 需 要 写 完 全 路 径 而 只 需 要 用 文 件 名 即 可 。 1 . 6 R S t u d i o 软 件 1 . 6 . 1 介 绍 R S t u d i o 软 件 是 R 软 件 的 应 用 界 面 与 增 强 系 统 ， 可 以 在 其 中 编 辑 、 运 行 R 的 程 序 文 件 ， 可 以 跟 踪 运 行 ， 还 可 以 构 造 文 字 、 R 结 果 图 表 融 合 在 一 起 的 研 究 报 告 、 论 文 、 图 书 、 网 站 等 。 一 个 运 行 中 的 R S t u d i o 界 面 见 图 1 . 2 。 图 1 . 2 : R S t u d i o 截 图 界 面 一 般 分 为 四 个 窗 格 ， 其 中 编 辑 窗 口 与 控 制 台 （ C o n s o l e ） 是 最 重 要 的 两 个 窗 格 。 编 辑 窗 格 用 来 查 看 和 编 辑 程 序 、 文 本 型 的 数 据 文 件 、 程 序 与 文 字 融 合 在 一 起 的 R m d 文 件 等 。 控 制 台 与 基 本 R 软 件 的 命 令 行 窗 口 基 本 相 同 ， 功 能 有 所 增 强 。 在 编 辑 窗 口 中 可 以 用 操 作 系 统 中 常 用 的 编 辑 方 法 对 源 文 件 进 行 编 辑 ， 如 复 制 、 粘 贴 、 查 找 、 替 换 ， 还 支 持 基 于 正 则 表 达 式 的 查 找 替 换 （ 关 于 正 则 表 达 式 见 4 8 ） 。 其 它 的 一 些 重 要 窗 格 包 括 ： F i l e s : 列 出 当 前 项 目 的 目 录 （ 文 件 夹 ） 内 容 。 其 中 以 . R 或 者 . r 为 扩 展 名 的 是 R 源 程 序 文 件 ， 单 击 某 一 源 程 序 文 件 就 可 以 在 编 辑 窗 格 中 打 开 该 文 件 。 P l o t s : 如 果 程 序 中 有 绘 图 结 果 ， 将 会 显 示 在 这 个 窗 格 。 因 为 绘 图 需 要 足 够 的 空 间 ， 所 以 当 屏 幕 分 辨 率 过 低 或 者 P l o t s 窗 格 太 小 的 时 候 ， 可 以 点 击 “ Z o o m ” 图 标 将 图 形 显 示 在 一 个 单 独 的 窗 口 中 ， 或 者 将 图 形 窗 口 作 为 唯 一 窗 格 显 示 。 如 何 放 大 窗 格 见 下 面 的 使 用 技 巧 。 H e l p : R 软 件 的 文 档 与 R S t u d i o 的 文 档 都 在 这 里 。 E n v i r o n m e n t : 已 经 有 定 义 的 变 量 、 函 数 都 显 示 在 这 里 。 H i s t o r y : 以 前 运 行 过 的 命 令 都 显 示 在 这 里 。 不 限 于 本 次 R S t d u d i o 运 行 期 间 ， 也 包 括 以 前 使 用 R S t u d i o 时 运 行 过 的 命 令 。 P a c k a g e s : 显 示 已 安 装 的 R 扩 展 包 及 其 文 档 。 V i e w e r , C o n n e c t i o n , B u i l d , G i t 等 窗 格 。 1 . 6 . 2 项 目 用 R 和 R S t u d i o 进 行 研 究 和 数 据 分 析 ， 每 个 研 究 问 题 应 该 单 独 建 立 一 个 文 件 夹 （ 目 录 ） 。 该 问 题 的 所 有 数 据 、 程 序 都 放 在 对 应 的 文 件 夹 中 。 在 R S t u d i o 中 ， 用 “ F i l e – N e w P r o j e c t – E x i s t i n g D i r e c t o r y ” 选 中 该 问 题 的 目 录 ， 建 立 一 个 新 的 “ 项 目 ” （ p r o j e c t ） 。 再 次 进 入 R S t u d i o 后 ， 用 菜 单 “ F i l e – R e c e n t P r o j e c t s ” 找 到 已 有 的 项 目 打 开 ， 然 后 就 可 以 针 对 该 项 目 进 行 分 析 了 。 这 样 分 项 目 进 行 研 究 的 好 处 是 ， 不 同 项 目 的 可 以 使 用 同 名 的 文 件 而 不 会 有 冲 突 ， 程 序 中 用 到 某 个 文 件 时 ， 只 需 要 写 文 件 名 而 不 需 要 写 文 件 所 在 的 目 录 。 一 个 项 目 还 可 以 有 项 目 本 身 的 一 些 特 殊 设 置 ， 用 “ T o o l s – P r o j e c t O p t i o n s ” 菜 单 打 开 设 置 。 1 . 6 . 3 帮 助 在 R S t u d i o 中 有 一 个 单 独 的 H e l p 窗 格 ， 如 果 需 要 ， 可 以 用 菜 单 “ V i e w – P a n e s – Z o o m h e l p ” 将 其 放 大 到 占 据 整 个 窗 口 空 间 。 但 是 ， 这 一 功 能 目 前 不 支 持 放 大 显 示 字 体 的 功 能 ， 不 如 在 浏 览 器 中 方 便 。 R S t u d i o 的 帮 助 窗 格 中 包 含 R 软 件 的 官 方 文 档 ， 以 及 R S t u d i o 软 件 的 的 文 档 。 “ S e a r c h e n g i n e a n d k e y w o r d s ” 项 下 面 有 分 类 的 帮 助 。 有 软 件 包 列 表 。 在 基 本 R 软 件 而 不 是 R S t u d i o 的 命 令 行 中 运 行 命 令 h e l p . s t a r t ( ) 或 者 用 R G U I 的 帮 助 菜 单 中 “ h t m l 帮 助 ” 可 以 打 开 系 统 默 认 的 互 联 网 浏 览 器 ， 在 其 中 查 看 帮 助 文 档 。 在 命 令 行 ， 用 问 号 后 面 跟 随 函 数 名 查 询 某 函 数 的 帮 助 。 用 e x a m p l e ( 函 数 名 ) 的 格 式 可 以 运 行 此 函 数 的 样 例 ， 如 : ? m e a n e x a m p l e ( m e a n ) 有 时 仅 知 道 一 些 方 法 的 名 字 而 不 知 道 具 体 的 扩 展 包 和 函 数 名 称 ， 可 以 安 装 s o s 扩 展 包 （ p a c k a g e ） ， 用 f i n d F n ( 函 数 名 ) 查 询 某 个 函 数 ， 结 果 显 示 在 互 联 网 浏 览 器 软 件 中 。 1 . 6 . 4 使 用 技 巧 R S t u d i o 使 用 方 法 概 要 P D F 下 载 ： r s t u d i o i d e . p d f 。 1 . 6 . 4 . 1 使 用 历 史 在 控 制 台 （ 命 令 行 窗 格 ） 中 ， 除 了 可 以 用 左 右 光 标 键 移 动 光 标 位 置 ， 用 上 下 光 标 键 调 回 以 前 运 行 过 的 命 令 ， 还 有 一 个 重 要 的 增 强 （ 以 M S W i n d o w s 操 作 系 统 为 例 ） ： 键 入 要 运 行 的 命 令 的 前 几 个 字 母 ， 如 b o o k ， 按 “ C t r l + 向 上 光 标 键 ” ， 就 可 以 显 示 历 史 命 令 中 以 b o o k 开 头 的 所 有 命 令 ， 单 击 哪 一 个 ， 哪 一 个 就 自 动 复 制 到 命 令 行 。 这 一 技 巧 十 分 重 要 ， 我 们 需 要 反 复 运 行 同 一 命 令 或 类 似 命 令 时 ， 这 一 方 法 让 我 们 很 容 易 从 许 多 命 令 历 史 中 找 到 所 需 的 命 令 。 1 . 6 . 4 . 2 放 大 显 示 某 一 窗 格 当 屏 幕 分 辨 率 较 低 时 ， 将 整 个 R S t u d i o 界 面 分 为 四 个 窗 格 会 使 得 每 个 窗 格 都 没 有 足 够 的 显 示 精 度 。 为 此 ， 可 以 将 某 个 窗 格 放 大 到 整 个 窗 口 区 域 ， 需 要 使 用 其 它 窗 格 时 再 恢 复 到 四 个 窗 格 的 状 态 或 者 直 接 放 大 其 它 窗 格 到 整 个 窗 口 区 域 。 使 用 菜 单 “ V i e w – P a n e s – Z o o m S o u r c e ” 可 以 将 编 辑 窗 格 放 到 最 大 ， 在 M S W i n d o w s 下 也 可 以 使 用 快 捷 键 “ C t r l + A l t + 1 ” 。 其 它 操 作 系 统 也 有 类 似 的 快 捷 键 可 用 。 使 用 菜 单 “ V i e w – P a n e s – S h o w A l l P a n e s ” 可 以 显 示 所 有 四 个 窗 格 。 放 大 其 它 窗 格 也 可 以 用 “ C t r l + A l t + 数 字 ” ， 数 字 与 窗 格 的 对 应 关 系 为 ： 1 : 编 辑 窗 格 ； 2 : 控 制 台 （ C o n s o l e ） ； 3 : 帮 助 ； 4 : 历 史 ； 5 : 文 件 ； 6 : 图 形 ； 7 : 扩 展 包 ； 8 : 已 定 义 变 量 和 函 数 ； 9 : 研 究 报 告 或 网 站 结 果 显 示 。 1 . 6 . 4 . 3 运 行 程 序 可 以 在 命 令 行 直 接 输 入 命 令 运 行 ， 文 字 结 果 会 显 示 在 命 令 行 窗 口 ， 图 形 结 果 显 示 在 “ P l o t s ” 窗 格 中 。 在 命 令 行 窗 口 （ C o n s o l e ） 中 可 以 用 左 右 光 标 键 移 动 光 标 ， 用 上 下 光 标 键 查 找 历 史 命 令 ， 输 入 命 令 的 前 几 个 字 母 后 用 “ C t r l + 向 上 光 标 键 ” 可 以 匹 配 地 查 找 历 史 命 令 。 一 般 情 况 下 ， 还 是 应 该 将 R 源 程 序 保 存 在 一 个 源 程 序 文 件 中 运 行 。 R S t u d i o 中 “ F i l e – N e w F i l e – R S c r i p t ” 可 以 打 开 一 个 新 的 无 名 的 R 源 程 序 文 件 窗 口 供 输 入 R 源 程 序 用 。 输 入 一 些 程 序 后 ， 保 存 文 件 ， 然 后 点 击 “ S o u r c e ” 快 捷 图 标 就 可 以 运 行 整 个 文 件 中 的 所 有 源 程 序 ， 并 会 自 动 加 上 关 于 编 码 的 选 项 。 编 写 R 程 序 的 正 常 做 法 是 一 边 写 一 边 试 验 运 行 ， 运 行 一 般 不 是 整 体 的 运 行 而 是 写 完 一 部 分 就 运 行 一 部 分 ， 运 行 没 有 错 误 才 继 续 编 写 下 一 部 分 。 在 R 源 程 序 窗 口 中 ， 当 插 入 光 标 在 某 行 程 序 上 的 时 候 ， 点 击 窗 口 的 “ R u n ” 快 捷 图 标 或 者 用 快 捷 键 “ C t r l + E n t e r 键 ” 可 以 运 行 该 行 ； 选 中 若 干 程 序 行 后 ， 点 击 窗 口 的 “ R u n ” 快 捷 图 标 或 者 用 快 捷 键 “ C t r l + E n t e r 键 ” 可 以 运 行 这 些 行 。 1 . 6 . 4 . 4 注 释 和 源 文 件 框 架 R 源 文 件 中 用 井 号 （ # ） 开 头 的 行 ， 以 及 行 内 从 井 号 开 始 的 部 分 为 注 释 。 对 于 较 长 的 源 文 件 ， 应 适 当 分 节 ， 在 R S t u d i o 软 件 中 ， 可 以 用 特 殊 的 注 释 进 行 分 节 ， 并 可 点 击 源 程 序 编 辑 窗 格 右 上 角 的 “ O u t l i n e ” 快 捷 图 标 显 示 源 程 序 分 节 结 构 。 这 种 特 殊 的 注 释 格 式 如 ： # 1 . 辅 助 函 数 # # # # # # 1 . 1 函 数 A # # # # # # 1 . 2 函 数 B # # # # # # # 1 . 2 . 1 说 明 # 2 . 输 入 数 据 # 3 . 建 模 特 殊 注 释 的 末 尾 有 4 个 以 上 的 井 号 ， 开 头 用 1 到 多 个 井 号 表 示 框 架 分 级 ， 开 头 井 号 越 少 ， 级 别 越 高 。 目 前 这 样 的 特 殊 注 释 对 中 文 的 识 别 能 力 不 好 ， 所 以 需 要 用 编 号 数 字 帮 助 正 确 识 别 结 构 层 级 。 1 . 6 . 4 . 5 中 文 编 码 问 题 对 于 中 文 内 容 的 R 源 程 序 、 R M a r k d o w n 源 文 件 （ . R m d 文 件 ） 、 文 本 型 数 据 文 件 ( . t x t ， . c s v ) ， 其 中 的 中 文 内 容 可 能 有 不 同 的 编 码 选 择 ， 在 中 国 除 港 澳 台 以 外 的 地 区 主 要 使 用 G B 1 8 0 3 0 ( 基 本 兼 容 于 G B , G B K ) 和 U T F 8 ， U T F 8 是 国 际 上 更 普 遍 使 用 的 统 一 文 字 编 码 ， 涉 及 到 计 算 机 编 程 时 应 尽 可 能 使 用 此 编 码 系 统 。 在 R S t u d i o 中 新 生 成 的 R 源 程 序 、 R m d 源 文 件 一 般 自 动 用 U T F 8 编 码 。 点 击 R S t u d i o 的 文 件 窗 格 中 显 示 的 源 文 件 ， 可 以 打 开 该 源 文 件 ， 但 是 因 为 已 有 源 文 件 的 编 码 不 一 定 与 R S t u d i o 的 默 认 编 码 一 致 ， 可 以 会 显 示 成 乱 码 。 为 此 ， R S t d i o 提 供 了 “ F i l e – R e o p e n w i t h E n c o d i n g ” 命 令 ， 我 们 主 要 试 验 其 中 G B 1 8 0 3 0 和 U T F 8 两 种 选 择 一 般 就 可 以 解 决 问 题 。 如 果 选 择 G B 1 8 0 3 0 显 示 就 没 有 乱 码 了 ， 最 好 再 用 菜 单 “ F i l e – S a v e w i t h E n c o d i n g ” 并 选 择 U T F 8 将 其 保 存 为 U T F 8 编 码 。 其 它 的 文 本 格 式 的 文 件 也 可 以 类 似 地 处 理 ， 后 面 将 会 陆 续 提 及 。 1 . 7 Q m d 文 件 在 科 学 研 究 中 ， R 软 件 可 以 用 来 分 析 数 据 ， 生 成 数 据 分 析 报 表 和 图 形 。 Q u a r t o ( 简 称 Q m d ) 是 一 种 特 殊 的 文 件 格 式 ， 在 这 种 文 件 中 ， 既 有 R 程 序 ， 又 有 说 明 文 字 ， 通 过 R 和 R S t u d i o 软 件 ， 可 以 运 行 其 中 的 程 序 ， 并 将 说 明 文 字 、 程 序 、 程 序 的 文 字 结 果 、 图 形 结 果 统 一 地 转 换 为 一 个 研 究 报 告 ， 支 持 W o r d 、 P D F 、 网 页 、 网 站 、 幻 灯 片 等 许 多 种 输 出 格 式 。 在 打 开 的 Q m d 源 文 件 中 ， 也 可 以 选 择 其 中 的 某 一 段 R 程 序 单 独 运 行 。 所 以 ， Q m d 文 件 也 可 以 作 为 一 种 特 殊 的 R 源 程 序 文 件 。 用 R S t u d i o 的 “ F i l e – N e w F i l e – Q u a r t o D o c u m e n t ” 菜 单 就 可 以 生 成 一 个 新 的 Q m d 文 件 并 显 示 在 编 辑 窗 格 中 ， 其 中 已 经 有 了 一 些 样 例 内 容 ， 可 以 修 改 这 些 样 例 内 容 为 自 己 的 文 字 和 程 序 。 Q m d 文 件 中 用 ` ` ` 开 头 ， 用 ` ` ` 结 尾 的 段 落 是 R 程 序 段 ， 在 显 示 的 程 序 段 的 右 侧 有 一 个 向 右 箭 头 形 状 的 小 图 标 （ 类 似 于 媒 体 播 放 图 标 ） ， 点 击 该 图 标 就 可 以 运 行 该 程 序 段 。 打 开 Q m d 文 件 后 ， 用 编 辑 窗 口 的 R e n d e r 命 令 可 以 选 择 将 文 件 整 个 地 转 换 为 H T M L ( 网 页 ) 或 者 M S W o r d 格 式 ， 如 果 操 作 系 统 中 安 装 有 L a T e X 软 件 ， 还 可 以 以 L a T e X 为 中 间 格 式 转 换 为 P D F 文 件 。 为 了 将 网 页 转 换 为 P D F 文 件 ， 建 议 使 用 C h r o m e 浏 览 器 打 开 H T M L 文 件 ， 然 后 选 择 菜 单 “ 打 印 ” ， 选 打 印 机 为 “ 另 存 为 P D F ” ， 然 后 选 “ 更 多 设 置 ” ， 将 其 中 的 “ 缩 放 ” 改 为 自 定 义 ， 比 例 改 为 “ 9 0 % ” 。 详 见 2 0 、 2 1 、 2 2 。 1 . 8 练 习 下 载 R 安 装 程 序 ， 安 装 R ， 建 立 w o r k 文 件 夹 并 在 其 中 建 立 R 的 快 捷 方 式 。 W i n d o w s 用 户 还 需 要 下 载 R T o o l s 软 件 并 安 装 。 下 载 R S t u d i o 软 件 并 安 装 。 在 w o r k 文 件 夹 中 建 立 一 个 新 的 项 目 。 下 载 安 装 n o t e p a d + + 软 件 ( 仅 M S W i n d o w s 用 户 ) 。 在 R S t u d i o 中 下 载 安 装 s o s 扩 展 软 件 包 。 R e f e r e n c e s B e c k e r , R . A . , a n d J . M . C h a m b e r s . 1 9 8 4 . S : A n I n t e r a c t i v e E n v i r o n m e n t f o r D a t a A n a l y s i s a n d G r a p h i c s . W a d s w o r t h A d v a n c e d B o o k s P r o g r a m , B e l m o n t C A . B e c k e r , R i c h a r d A . , J o h n M . C h a m b e r s , a n d A l l a n R e e v e W i l k s . 1 9 8 8 . T h e N e w S L a n g u a g e . C h a p m a n ; H a l l , N e w Y o r k . C h a m b e r s , J . M . 2 0 1 6 . E x t e n d i n g R . C h a p m a n ; H a l l / C R C , L o n d o n . C h a m b e r s , J . M . , a n d T . H a s t i e . 1 9 9 2 . S t a t i s t i c a l M o d e l s i n S . C h a p m a n ; H a l l , N e w Y o r k . C h a m b e r s , J o h n M . 1 9 9 8 . P r o g r a m m i n g w i t h D a t a a G u i d e t o t h e S L a n g u a g e . S p r i n g e r .

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